More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6236 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  85.4 
 
 		 455 aa  756    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  81.7 
 
 		 457 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  906    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  96.27 
 
 		 456 aa  840    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  49.65 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  49.43 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.76 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  47 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  48.26 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2535  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  45.7 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  49.16 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  46.03 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  44.59 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  41.19 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 439 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.56 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.92 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  44.17 
 
 		 461 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  44.17 
 
 		 461 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  44.17 
 
 		 461 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  42.76 
 
 		 456 aa  325  9e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 439 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.05 
 
 		 446 aa  317  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  40.95 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 458 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 453 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  41.94 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 450 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.13 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 		 448 aa  310  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.28 
 
 		 447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  40.47 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  40.32 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 442 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  41.43 
 
 		 459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.62 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 		 430 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  43.74 
 
 		 452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 		 449 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  42 
 
 		 445 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  42 
 
 		 445 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 		 465 aa  302  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  41.37 
 
 		 460 aa  302  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  42 
 
 		 445 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  41.07 
 
 		 441 aa  300  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  40.79 
 
 		 433 aa  299  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  42.09 
 
 		 443 aa  299  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 457 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  40.05 
 
 		 442 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  41.39 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  41.39 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  41.39 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 442 aa  296  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  41.15 
 
 		 435 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  41.15 
 
 		 435 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  41.11 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  41.15 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.9 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.08 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  39.32 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  39.77 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  38.34 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>