More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5058 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  76.82 
 
 		 467 aa  670    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  74.53 
 
 		 468 aa  717    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  75.88 
 
 		 460 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 468 aa  910    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  76.02 
 
 		 464 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  56.1 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  55.88 
 
 		 473 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  54.99 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.66 
 
 		 459 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  56.24 
 
 		 457 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  53.25 
 
 		 473 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  53.78 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  53.78 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  53.78 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  53.78 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  53.55 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  54.1 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.1 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  54.1 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  54.1 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  54.1 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.1 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  54.21 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  44.35 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  44.37 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  43.43 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  36.77 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 446 aa  285  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 462 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  38.48 
 
 		 468 aa  279  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 475 aa  275  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.49 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  37.42 
 
 		 439 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.83 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.83 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.83 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 440 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 435 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 435 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 435 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  38.23 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  38.6 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  37.27 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.81 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  36.2 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 439 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  35.37 
 
 		 439 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  34.51 
 
 		 438 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.51 
 
 		 438 aa  253  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  34.51 
 
 		 438 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  34.83 
 
 		 449 aa  253  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  34.83 
 
 		 449 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  33.86 
 
 		 437 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  37.36 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 435 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  34.29 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  34.29 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  35.43 
 
 		 433 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  35.17 
 
 		 430 aa  249  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  34.29 
 
 		 438 aa  249  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  34.07 
 
 		 438 aa  249  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  34.65 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  35.43 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  38.46 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  35.43 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  35.43 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  35.37 
 
 		 450 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  34.03 
 
 		 484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 458 aa  246  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 442 aa  246  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  35.43 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  34.98 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  35.4 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>