More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1912 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
475 aa  934    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  63.1 
 
 
478 aa  561  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  61.73 
 
 
466 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  60.48 
 
 
482 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  60.36 
 
 
472 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  48.44 
 
 
474 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 
449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  46.27 
 
 
449 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  44.87 
 
 
462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  40.91 
 
 
460 aa  323  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  39.73 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  38.65 
 
 
453 aa  317  4e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 
468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  38.94 
 
 
464 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.64 
 
 
455 aa  299  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
468 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  37.94 
 
 
461 aa  296  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  37.96 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.9 
 
 
446 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.9 
 
 
446 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.9 
 
 
446 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.9 
 
 
446 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  35.33 
 
 
430 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  36.32 
 
 
427 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.32 
 
 
427 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.24 
 
 
459 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  36.32 
 
 
427 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.32 
 
 
427 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.32 
 
 
427 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.32 
 
 
427 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  36.67 
 
 
446 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.32 
 
 
427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  37.76 
 
 
450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
473 aa  269  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  39.65 
 
 
444 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.8 
 
 
452 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.05 
 
 
468 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
457 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
452 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 
446 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  35.86 
 
 
450 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 
465 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.6 
 
 
445 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 
435 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  38.8 
 
 
442 aa  259  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  34.75 
 
 
437 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 
468 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 
440 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  38.35 
 
 
430 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 
473 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.16 
 
 
461 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.16 
 
 
461 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.16 
 
 
461 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  38.88 
 
 
445 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.88 
 
 
445 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.88 
 
 
445 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  35.54 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  38.39 
 
 
460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  36.22 
 
 
447 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  35.26 
 
 
458 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  35.1 
 
 
484 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  39.08 
 
 
445 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  36.75 
 
 
456 aa  253  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  38.26 
 
 
443 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  38.16 
 
 
460 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
438 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.21 
 
 
438 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  36.36 
 
 
450 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.95 
 
 
437 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  37 
 
 
447 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  34.85 
 
 
445 aa  249  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  37.12 
 
 
459 aa  247  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  36.38 
 
 
439 aa  247  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  34.92 
 
 
458 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  37.35 
 
 
433 aa  246  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  35.39 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 
431 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  35 
 
 
449 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 
432 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3547  major facilitator transporter  35.29 
 
 
440 aa  243  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  34.78 
 
 
449 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.56 
 
 
437 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  38.34 
 
 
450 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  37.19 
 
 
438 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  34.93 
 
 
459 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  37.61 
 
 
483 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  34.7 
 
 
436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  35.34 
 
 
444 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  35.49 
 
 
444 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  35.34 
 
 
444 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  35.34 
 
 
444 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  36.78 
 
 
441 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  35.49 
 
 
444 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  39.03 
 
 
437 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  35.34 
 
 
444 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  38.8 
 
 
436 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>