More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3726 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  100 
 
 
482 aa  954    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  69.83 
 
 
472 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  62.61 
 
 
466 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  64.06 
 
 
478 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  60.67 
 
 
475 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  50.43 
 
 
474 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  51.47 
 
 
449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  50.34 
 
 
449 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  42.83 
 
 
460 aa  335  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  44.76 
 
 
462 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  40.04 
 
 
450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  39.41 
 
 
453 aa  319  9e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  39.08 
 
 
464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  37.28 
 
 
455 aa  296  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  39.1 
 
 
461 aa  293  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 
468 aa  286  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  39.05 
 
 
446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  39.05 
 
 
446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  39.05 
 
 
446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  39.05 
 
 
446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  37.89 
 
 
468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.44 
 
 
459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  38.83 
 
 
446 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  39.22 
 
 
467 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 
457 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  38.25 
 
 
442 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01502  predicted transporter  36.45 
 
 
427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2102  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.45 
 
 
427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1752  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.45 
 
 
427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000473238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2115  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.45 
 
 
427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0135318  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1633  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.45 
 
 
427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000157893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01513  hypothetical protein  36.45 
 
 
427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0227529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 
473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2159  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  36.45 
 
 
427 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0943239  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 
464 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
460 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  38.83 
 
 
450 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  38.08 
 
 
442 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  35.06 
 
 
450 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0804  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
457 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.18 
 
 
438 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
438 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  35.05 
 
 
484 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 
465 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  38.74 
 
 
452 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.73 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  37.23 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.25 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 
458 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  36.74 
 
 
445 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 
431 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  36.93 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  36.52 
 
 
445 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  36.52 
 
 
445 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  34.56 
 
 
430 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  37.02 
 
 
460 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  35.95 
 
 
461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  35.95 
 
 
461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  35.95 
 
 
461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  38.01 
 
 
442 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  38.95 
 
 
443 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  35.51 
 
 
445 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  37.25 
 
 
445 aa  250  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.89 
 
 
437 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  35.98 
 
 
441 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.64 
 
 
452 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 
452 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
437 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  35.84 
 
 
435 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  35.93 
 
 
434 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  35.4 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  35.4 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  36.62 
 
 
435 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  35.18 
 
 
435 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  35.18 
 
 
435 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  37.18 
 
 
435 aa  246  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  35.86 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  36.45 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  37.86 
 
 
450 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  36.41 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  36.41 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  37.32 
 
 
437 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  36.63 
 
 
460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1594  major facilitator transporter  36.21 
 
 
442 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000379312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  35.68 
 
 
439 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 
432 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  35.68 
 
 
439 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  35.68 
 
 
439 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  38.5 
 
 
460 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  37.81 
 
 
459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 
446 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  34.22 
 
 
459 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  35.42 
 
 
439 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 
435 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  34.51 
 
 
465 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>