More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2458 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  87.72 
 
 		 449 aa  768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  52.55 
 
 		 474 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0650  major facilitator superfamily MFS_1  51.58 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3115  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0627  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3726  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 482 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787651  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46710  Major facilitator superfamily transporter  48.57 
 
 		 472 aa  358  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1912  major facilitator superfamily MFS_1  46.52 
 
 		 475 aa  352  5.9999999999999994e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 461 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 438 aa  296  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  37.69 
 
 		 453 aa  295  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 450 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  36.78 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  39.46 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.53 
 
 		 438 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  40.44 
 
 		 430 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 		 468 aa  280  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 461 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 460 aa  276  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  37.3 
 
 		 447 aa  275  9e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.45 
 
 		 468 aa  273  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 445 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.27 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  37.84 
 
 		 467 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 445 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  38.26 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  38 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  35.65 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  37.7 
 
 		 482 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 442 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3351  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0813627  normal  0.0585989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.51 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 464 aa  249  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 458 aa  249  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  35.65 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  36.95 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  36.07 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  36.07 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  36.07 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  36.07 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  37.27 
 
 		 439 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.62 
 
 		 437 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.13 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.13 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.13 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 431 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  36.07 
 
 		 433 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  34.98 
 
 		 449 aa  243  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 442 aa  243  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  34.98 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 436 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2004  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 434 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  34.25 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.7 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  34.59 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  33.33 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  37.12 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.35 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 472 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.35 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.35 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 459 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.35 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  35.35 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>