More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2004 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  75.65 
 
 
436 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2004  major facilitator transporter  100 
 
 
434 aa  847    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  74.25 
 
 
436 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  76.44 
 
 
434 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4527  major facilitator transporter  95.38 
 
 
434 aa  761    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  64.12 
 
 
442 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  65.37 
 
 
437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  64.56 
 
 
460 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  63.04 
 
 
445 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  63.37 
 
 
458 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  57.07 
 
 
450 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  54.07 
 
 
457 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  58.85 
 
 
435 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  53.03 
 
 
458 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  53.1 
 
 
452 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  45.86 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  45.63 
 
 
439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  45.63 
 
 
439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.02 
 
 
439 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.67 
 
 
439 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.93 
 
 
437 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.42 
 
 
439 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  44.02 
 
 
439 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.02 
 
 
439 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.02 
 
 
439 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.02 
 
 
439 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  47.92 
 
 
439 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  45.17 
 
 
455 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.66 
 
 
450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.94 
 
 
437 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  42.99 
 
 
430 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 
442 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1456  major facilitator superfamily MFS_1  48.36 
 
 
453 aa  332  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 
465 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  45.3 
 
 
461 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
431 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.96 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  40.95 
 
 
439 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  43.44 
 
 
451 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.51 
 
 
437 aa  316  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 
440 aa  315  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  43.57 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  41.36 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  43.57 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.87 
 
 
441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  40.97 
 
 
449 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  40.74 
 
 
449 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.36 
 
 
442 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  41.3 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  41.3 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  41.79 
 
 
435 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  40.28 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  40.28 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  40.28 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  40.86 
 
 
450 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  42.24 
 
 
437 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  41.55 
 
 
434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  41.3 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  41.3 
 
 
435 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  41.3 
 
 
435 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.75 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.75 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  44.89 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.75 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.9 
 
 
438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.32 
 
 
433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  43.53 
 
 
460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 
461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.35 
 
 
439 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  43.59 
 
 
439 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  41.56 
 
 
435 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  42.33 
 
 
460 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 
438 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.58 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  39.95 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.11 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
437 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  42.96 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  40.8 
 
 
484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  42.02 
 
 
436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  43.2 
 
 
445 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  43.2 
 
 
445 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  43.03 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  41.07 
 
 
447 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  42.96 
 
 
445 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.18 
 
 
441 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  42.64 
 
 
439 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.55 
 
 
446 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  40.24 
 
 
441 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  42.99 
 
 
436 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  40 
 
 
437 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  43.03 
 
 
436 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  43.03 
 
 
436 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  43.03 
 
 
436 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  40.18 
 
 
443 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  43.96 
 
 
455 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  46.6 
 
 
432 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  46.6 
 
 
432 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  40.75 
 
 
456 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>