More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11224 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  100 
 
 
425 aa  827    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  44.13 
 
 
456 aa  355  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  44.04 
 
 
465 aa  349  6e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  41.12 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  40.45 
 
 
463 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  40.45 
 
 
463 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  40.45 
 
 
463 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  42.99 
 
 
506 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  42.86 
 
 
489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  41.76 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  43.09 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  42.33 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  43.09 
 
 
437 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  40.15 
 
 
425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.53 
 
 
430 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.95 
 
 
436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  41.76 
 
 
437 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  41.76 
 
 
436 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  41.26 
 
 
436 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  41.53 
 
 
483 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  41.49 
 
 
437 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  41.53 
 
 
436 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.75 
 
 
441 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  38.73 
 
 
457 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.53 
 
 
440 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 
420 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  37.28 
 
 
470 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.73 
 
 
457 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.73 
 
 
457 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  42.62 
 
 
437 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  42.08 
 
 
420 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.81 
 
 
468 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  42.62 
 
 
437 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  42.62 
 
 
437 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  42.39 
 
 
523 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.77 
 
 
441 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.82 
 
 
435 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39.38 
 
 
433 aa  278  9e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  41.69 
 
 
456 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  38.16 
 
 
466 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.2 
 
 
442 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.22 
 
 
433 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  37.28 
 
 
470 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.28 
 
 
440 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.62 
 
 
439 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.42 
 
 
438 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.56 
 
 
438 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  41.91 
 
 
431 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  41.92 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  40.76 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  41.46 
 
 
445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  38.28 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  43.51 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.27 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  41.16 
 
 
443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 
435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.15 
 
 
432 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.19 
 
 
450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  39.39 
 
 
628 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  36.83 
 
 
447 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 
436 aa  272  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  40.61 
 
 
438 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.13 
 
 
433 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 
440 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  38.69 
 
 
441 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  37.84 
 
 
446 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  41.2 
 
 
412 aa  269  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  38.78 
 
 
482 aa  269  8e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  41.82 
 
 
433 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  37.53 
 
 
439 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 
461 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  43 
 
 
437 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  39.91 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  38.63 
 
 
441 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
839 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  40.42 
 
 
438 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  39.67 
 
 
440 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  39.67 
 
 
440 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  39.67 
 
 
440 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  39.67 
 
 
440 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 
433 aa  266  5.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  42.21 
 
 
439 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 
442 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.2 
 
 
434 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.18 
 
 
447 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 
431 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  43.77 
 
 
437 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 
456 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.53 
 
 
444 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.88 
 
 
441 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  42.6 
 
 
432 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  42.6 
 
 
432 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  39.72 
 
 
450 aa  262  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  42.6 
 
 
432 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  36.03 
 
 
463 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  36.88 
 
 
436 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
420 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.36 
 
 
441 aa  260  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>