More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2888 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  100 
 
 		 434 aa  854    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  73.54 
 
 		 431 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  68.66 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.44 
 
 		 436 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  61.28 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  61.5 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  59.52 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  58.85 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  58.85 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  55.14 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.48 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.31 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  57.6 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.16 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.31 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.04 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  49.18 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  49.18 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  49.18 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.38 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.83 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  47.38 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  56.17 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  49.22 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  49.65 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  52.87 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  52.63 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.63 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  52.63 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  52.39 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  52.39 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  52.63 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.63 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  52.63 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.22 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  53.22 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  53.22 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.22 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.22 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  50 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  45.75 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  50 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  50 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  50 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  50 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  49.76 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  45.53 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  48.72 
 
 		 628 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  49.3 
 
 		 438 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  46.35 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.27 
 
 		 435 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  49.02 
 
 		 435 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  51.87 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.12 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  51.54 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.47 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  50.48 
 
 		 433 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  49.88 
 
 		 489 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  49.88 
 
 		 437 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.47 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  49.63 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  47.26 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  49.52 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  48.91 
 
 		 506 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  49.14 
 
 		 523 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  49.14 
 
 		 437 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  49.14 
 
 		 437 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  49.14 
 
 		 437 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  49.4 
 
 		 456 aa  348  8e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  47.25 
 
 		 472 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  47.79 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  47.25 
 
 		 438 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  49.49 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  50.39 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  47.95 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 839 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.79 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  46.97 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 434 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.48 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  39.08 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  39.08 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.13 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  45.33 
 
 		 465 aa  290  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 432 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.96 
 
 		 432 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>