More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2535 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2535  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  871    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 456 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 454 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 457 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  43.22 
 
 		 455 aa  312  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.57 
 
 		 437 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 439 aa  306  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 439 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 439 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.48 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  41.36 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 439 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  40.68 
 
 		 440 aa  299  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.45 
 
 		 468 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 439 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  39.36 
 
 		 524 aa  289  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  41.37 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.79 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.69 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  39.96 
 
 		 460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.67 
 
 		 430 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.54 
 
 		 446 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  43.1 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.07 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  38.2 
 
 		 463 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  38.63 
 
 		 444 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 439 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.64 
 
 		 438 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  39.2 
 
 		 433 aa  279  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  39.95 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  42.12 
 
 		 427 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  39.57 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 445 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.36 
 
 		 447 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  39.04 
 
 		 436 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  38.06 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_003296  RS02317  transporter transmembrane protein  41.08 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.14358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.7 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.59 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.59 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.59 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  40.09 
 
 		 439 aa  272  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  37.98 
 
 		 465 aa  272  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  38.46 
 
 		 450 aa  272  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.66 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 460 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.66 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  40.62 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  39.57 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 436 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 454 aa  270  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  40.45 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  39.42 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  39.67 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  39.04 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  38.13 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  39.42 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  39.86 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 452 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  39.86 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  39.86 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>