More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0462 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  78.38 
 
 		 447 aa  702    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  892    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 478 aa  351  2e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2375  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.529747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 455 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.21 
 
 		 449 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 454 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 454 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 454 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  28.54 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  29.64 
 
 		 438 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 439 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  28.57 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2986  general substrate transporter  30.61 
 
 		 449 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  30.96 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  29.48 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 407 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  29.15 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 426 aa  133  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  27.27 
 
 		 422 aa  132  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  29.01 
 
 		 436 aa  132  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  26.1 
 
 		 456 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1055  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.367509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0131  general substrate transporter  25.71 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482205  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  27.88 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  28.39 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 420 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1953  general substrate transporter  26.17 
 
 		 544 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  27.23 
 
 		 431 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3351  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 444 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0813627  normal  0.0585989 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  26.73 
 
 		 433 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  25.98 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.22 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  26.5 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  26.5 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  26.5 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  28.77 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  28.73 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 511 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.38 
 
 		 408 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 406 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 408 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1369  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.38 
 
 		 408 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4657  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.38 
 
 		 408 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.38 
 
 		 408 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.38 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  27.83 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  27.83 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  27.83 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  27.83 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  27.83 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  26.73 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 467 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  27.83 
 
 		 444 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>