More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0131 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0131  general substrate transporter  100 
 
 		 446 aa  894    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0176  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.877079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  37.9 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 487 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  36.76 
 
 		 468 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  36.76 
 
 		 468 aa  279  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  36.3 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1409  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 498 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2995  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 494 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000112139  normal  0.562927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  42.53 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  44.71 
 
 		 539 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  43.33 
 
 		 539 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  44.41 
 
 		 539 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  43.33 
 
 		 539 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3972  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 		 553 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 527 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 422 aa  260  4e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3289  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 625 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  39.64 
 
 		 574 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  40.84 
 
 		 552 aa  259  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  42.9 
 
 		 552 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  41.18 
 
 		 552 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  40.36 
 
 		 552 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 632 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 632 aa  254  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  36.57 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  40.68 
 
 		 552 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  42.59 
 
 		 560 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  40.68 
 
 		 552 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  40.68 
 
 		 552 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  42.33 
 
 		 558 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 563 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 552 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  40 
 
 		 525 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 439 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.72 
 
 		 468 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 439 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3784  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 533 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  40.06 
 
 		 552 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8529  General substrate transporter  39.52 
 
 		 542 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1427  MFS family transporter  43.5 
 
 		 539 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  40.68 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  40.68 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  40.37 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  40.68 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  40.68 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 564 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2379  general substrate transporter  42.28 
 
 		 573 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  42.59 
 
 		 564 aa  250  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  40.87 
 
 		 564 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16410  putative MFS transporter  42.73 
 
 		 539 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2188  general substrate transporter  41.39 
 
 		 561 aa  250  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  40.87 
 
 		 553 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  39.47 
 
 		 552 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  40.17 
 
 		 525 aa  249  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 439 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1561  major facilitator transporter  42.81 
 
 		 556 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 552 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  38.53 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  39.44 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  36.57 
 
 		 563 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 565 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  36.57 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  39.76 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 567 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2061  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 526 aa  246  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 567 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  38.99 
 
 		 567 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 565 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 629 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  36.02 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1946  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 541 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  37.86 
 
 		 539 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  34.99 
 
 		 444 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  39.64 
 
 		 556 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 554 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 558 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5595  general substrate transporter  39.88 
 
 		 560 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 552 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  35.71 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  34.33 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 554 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4821  general substrate transporter  39.02 
 
 		 554 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0047  general substrate transporter  41.89 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 556 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1334  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 568 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  39.57 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2663  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.11892 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>