More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1721 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  100 
 
 		 432 aa  842    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  66.11 
 
 		 422 aa  553  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  64.85 
 
 		 422 aa  548  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0265  general substrate transporter  65.48 
 
 		 421 aa  533  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.931457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  39.9 
 
 		 442 aa  318  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0176  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.877079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  39.77 
 
 		 468 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  38.88 
 
 		 468 aa  295  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 487 aa  292  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  38.6 
 
 		 468 aa  292  7e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  45.06 
 
 		 539 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 565 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  43.57 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 552 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  42.09 
 
 		 574 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  46.15 
 
 		 567 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 567 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  44.87 
 
 		 552 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 		 567 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 552 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  44.55 
 
 		 552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  43.75 
 
 		 552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  43.57 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  38.16 
 
 		 564 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  42.81 
 
 		 632 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  44.48 
 
 		 539 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0851  MFS family sugar transporter  44.13 
 
 		 556 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734503  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  44.55 
 
 		 552 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 564 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  44.79 
 
 		 539 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  41.95 
 
 		 552 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  44.06 
 
 		 560 aa  273  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 552 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 565 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  42.5 
 
 		 632 aa  272  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  42.07 
 
 		 558 aa  272  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  43.91 
 
 		 552 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  43.91 
 
 		 552 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  43.91 
 
 		 552 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1411  general substrate transporter  45.11 
 
 		 549 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.966407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  41.55 
 
 		 552 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  44.48 
 
 		 539 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  42.05 
 
 		 564 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  43.81 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  44.48 
 
 		 539 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  43.91 
 
 		 552 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3289  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 625 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  42.81 
 
 		 557 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  43.59 
 
 		 552 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  43.59 
 
 		 552 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  43.59 
 
 		 552 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  43.59 
 
 		 552 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3756  General substrate transporter  44.58 
 
 		 563 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3839  General substrate transporter  44.58 
 
 		 563 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.241641  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 527 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3698  major facilitator superfamily transporter  44.58 
 
 		 563 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 552 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 525 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  43.34 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0835  general substrate transporter  44.44 
 
 		 554 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0740201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  42.5 
 
 		 556 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5595  general substrate transporter  43.23 
 
 		 560 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 556 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2379  general substrate transporter  42.77 
 
 		 573 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  44.48 
 
 		 540 aa  267  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4226  General substrate transporter  44.84 
 
 		 628 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 629 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4821  general substrate transporter  42.54 
 
 		 554 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 		 511 aa  265  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  42.3 
 
 		 525 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0062  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 630 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1561  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 556 aa  265  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 442 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3352  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 565 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3902  General substrate transporter  43.55 
 
 		 628 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.207036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2965  general substrate transporter  43.69 
 
 		 557 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338503  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  41.3 
 
 		 553 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2061  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 526 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1409  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 498 aa  262  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3296  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 559 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2995  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 		 494 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000112139  normal  0.562927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 563 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16410  putative MFS transporter  46.69 
 
 		 539 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3146  general substrate transporter  43.38 
 
 		 559 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1427  MFS family transporter  46.69 
 
 		 539 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 514 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1953  general substrate transporter  41.3 
 
 		 544 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2569  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 558 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 554 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4361  MFS permease  42.24 
 
 		 627 aa  256  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3972  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727747 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 554 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1334  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 568 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  37.73 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3353  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 563 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 439 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>