More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1082 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  96.58 
 
 		 468 aa  914    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  100 
 
 		 468 aa  937    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  95.73 
 
 		 468 aa  909    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2995  major facilitator superfamily MFS_1  56.22 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000112139  normal  0.562927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  53.31 
 
 		 487 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 481 aa  448  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  47.62 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0176  major facilitator transporter  48.57 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.877079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  55.52 
 
 		 539 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  57.19 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  58.82 
 
 		 564 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  57.1 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  58.82 
 
 		 564 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  58.82 
 
 		 564 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  57.19 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  58.33 
 
 		 553 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0851  MFS family sugar transporter  59.25 
 
 		 556 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734503  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  57.06 
 
 		 567 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  56.89 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  57.36 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  61.22 
 
 		 554 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  54.9 
 
 		 552 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  57.59 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  58.93 
 
 		 554 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  57.23 
 
 		 552 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  57.23 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  57.23 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  57.23 
 
 		 552 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  54.3 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1334  major facilitator transporter  60.18 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  57.23 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  57.23 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  56.66 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  55.36 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1409  major facilitator transporter  56 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  57.23 
 
 		 552 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  56.63 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  56.63 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  54.65 
 
 		 574 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3902  General substrate transporter  57.59 
 
 		 628 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.207036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  56.66 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  56.04 
 
 		 558 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  55.72 
 
 		 552 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  56.33 
 
 		 552 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  56.63 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  57.41 
 
 		 629 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0835  general substrate transporter  61.54 
 
 		 554 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0740201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  55.12 
 
 		 552 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  56.33 
 
 		 552 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  58.18 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  55.73 
 
 		 552 aa  365  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  55.12 
 
 		 565 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  56.33 
 
 		 552 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5595  general substrate transporter  58.47 
 
 		 560 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  56.33 
 
 		 552 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  56.88 
 
 		 565 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4821  general substrate transporter  60.5 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1411  general substrate transporter  58.13 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.966407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4226  General substrate transporter  57.28 
 
 		 628 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1561  major facilitator transporter  56.75 
 
 		 556 aa  362  6e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3289  major facilitator transporter  56.23 
 
 		 625 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  57.83 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  57.51 
 
 		 632 aa  360  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  57.91 
 
 		 525 aa  358  9e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3353  major facilitator transporter  57.44 
 
 		 563 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2379  general substrate transporter  55.46 
 
 		 573 aa  356  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2061  major facilitator superfamily MFS_1  56.65 
 
 		 526 aa  353  5e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  54.63 
 
 		 563 aa  352  5.9999999999999994e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  57.46 
 
 		 556 aa  352  8.999999999999999e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3352  major facilitator transporter  54.13 
 
 		 565 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2965  general substrate transporter  55.88 
 
 		 557 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338503  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3296  major facilitator transporter  54 
 
 		 559 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2569  major facilitator transporter  54 
 
 		 558 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  53.97 
 
 		 563 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1946  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3146  general substrate transporter  54 
 
 		 559 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3756  General substrate transporter  56.11 
 
 		 563 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3839  General substrate transporter  56.11 
 
 		 563 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.241641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3698  major facilitator superfamily transporter  56.11 
 
 		 563 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4361  MFS permease  55.7 
 
 		 627 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2188  general substrate transporter  56.06 
 
 		 561 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  57.37 
 
 		 558 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0062  major facilitator transporter  56.87 
 
 		 630 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1303  major facilitator superfamily MFS_1  54.37 
 
 		 568 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3972  major facilitator superfamily MFS_1  55.25 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  52.27 
 
 		 539 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  52.4 
 
 		 554 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  51.21 
 
 		 539 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  51.21 
 
 		 539 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  52.4 
 
 		 554 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  50.91 
 
 		 539 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2497  major facilitator superfamily MFS_1  51.99 
 
 		 562 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2788  major facilitator superfamily MFS_1  50.84 
 
 		 578 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2565  major facilitator transporter  50.84 
 
 		 578 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  52.81 
 
 		 540 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1427  MFS family transporter  54.91 
 
 		 539 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6133  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 		 552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376404  normal  0.0270764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 527 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16410  putative MFS transporter  54.6 
 
 		 539 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6348  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 		 577 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>