More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0715 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  100 
 
 		 442 aa  874    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  48.07 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  48.07 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  47.62 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 487 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  46.86 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0176  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.877079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  52.12 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  52.92 
 
 		 552 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  52.92 
 
 		 552 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  52.92 
 
 		 552 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  52.62 
 
 		 552 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  52.62 
 
 		 552 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  52.62 
 
 		 552 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  52.62 
 
 		 552 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  52.92 
 
 		 552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  52.52 
 
 		 552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  52.32 
 
 		 552 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  51.53 
 
 		 552 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  53.07 
 
 		 567 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  52.63 
 
 		 552 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  52.32 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  50.91 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  54.15 
 
 		 539 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  52.6 
 
 		 567 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  52.63 
 
 		 564 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  52.31 
 
 		 564 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  52.31 
 
 		 552 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  52.32 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  52.01 
 
 		 560 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  47.27 
 
 		 554 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  52.32 
 
 		 564 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 552 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  52.01 
 
 		 552 aa  335  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  46.08 
 
 		 554 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  52.01 
 
 		 558 aa  332  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  55.1 
 
 		 525 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1411  general substrate transporter  52.32 
 
 		 549 aa  329  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.966407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  51.84 
 
 		 565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0851  MFS family sugar transporter  41.81 
 
 		 556 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734503  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  51.07 
 
 		 567 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2379  general substrate transporter  50.15 
 
 		 573 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  50.3 
 
 		 511 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1334  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 568 aa  326  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  52.32 
 
 		 565 aa  326  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  49.85 
 
 		 553 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5595  general substrate transporter  46.7 
 
 		 560 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1409  major facilitator transporter  52.34 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  49.85 
 
 		 574 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0835  general substrate transporter  47.29 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0740201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3972  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 553 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4821  general substrate transporter  46.31 
 
 		 554 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2995  major facilitator superfamily MFS_1  52.81 
 
 		 494 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000112139  normal  0.562927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  50.32 
 
 		 629 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  49.85 
 
 		 632 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3289  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 625 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  49.54 
 
 		 632 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  49.54 
 
 		 556 aa  318  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3353  major facilitator transporter  50.3 
 
 		 563 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 		 514 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  49.25 
 
 		 556 aa  316  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  52.37 
 
 		 525 aa  315  7e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2569  major facilitator transporter  50.3 
 
 		 558 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  45.66 
 
 		 563 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2965  general substrate transporter  49.7 
 
 		 557 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338503  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3902  General substrate transporter  50.32 
 
 		 628 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.207036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0062  major facilitator transporter  50.31 
 
 		 630 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3146  general substrate transporter  50 
 
 		 559 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2188  general substrate transporter  50 
 
 		 561 aa  313  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4226  General substrate transporter  49.68 
 
 		 628 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3296  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 559 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3839  General substrate transporter  49.25 
 
 		 563 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.241641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3698  major facilitator superfamily transporter  49.25 
 
 		 563 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3756  General substrate transporter  49.25 
 
 		 563 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1561  major facilitator transporter  50.96 
 
 		 556 aa  309  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2061  major facilitator superfamily MFS_1  52.05 
 
 		 526 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3352  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 565 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4361  MFS permease  49.84 
 
 		 627 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84184  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  48.11 
 
 		 554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 563 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  48.11 
 
 		 554 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  41.36 
 
 		 432 aa  302  7.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 527 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  47.24 
 
 		 539 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  47.24 
 
 		 539 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  47.24 
 
 		 539 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1946  major facilitator transporter  49.84 
 
 		 541 aa  299  7e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  46.63 
 
 		 539 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8529  General substrate transporter  45.9 
 
 		 542 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  48.78 
 
 		 558 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6117  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 		 552 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154468  normal  0.620567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2497  major facilitator superfamily MFS_1  47.14 
 
 		 562 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2788  major facilitator superfamily MFS_1  46.13 
 
 		 578 aa  292  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2565  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 578 aa  292  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1303  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 568 aa  290  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  46.63 
 
 		 540 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>