More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1693 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  100 
 
 		 444 aa  883    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  68.6 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  65.05 
 
 		 444 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  64.81 
 
 		 444 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  65.57 
 
 		 444 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  63.78 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  60.22 
 
 		 467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  61.31 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  54.03 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  52.19 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  51.83 
 
 		 449 aa  425  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  58.22 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  49.77 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  44.76 
 
 		 434 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  44.5 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 445 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  41.67 
 
 		 441 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  42.49 
 
 		 495 aa  339  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  43.62 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  45.09 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  42.42 
 
 		 458 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  44.84 
 
 		 445 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  43.36 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  43.36 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  43.36 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  43.87 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  42.66 
 
 		 460 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  42.66 
 
 		 460 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  42.66 
 
 		 460 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.27 
 
 		 433 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  42.96 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  45.54 
 
 		 440 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  45.01 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  45.01 
 
 		 445 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  41.23 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  43.06 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  44.55 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  43.36 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  40.67 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  40.67 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  40.67 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 454 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  39.2 
 
 		 531 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  38.97 
 
 		 489 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 448 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 443 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 448 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  38.11 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  38.03 
 
 		 489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  38.03 
 
 		 489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1251  general substrate transporter  45.59 
 
 		 440 aa  312  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  38.5 
 
 		 503 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  37.7 
 
 		 493 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  39.23 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  39.23 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 495 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  39.23 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  39.23 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  39.23 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  38.26 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 463 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  37.79 
 
 		 489 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  39.23 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  44.26 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  39.23 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  39.23 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  37.33 
 
 		 496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  39.23 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.73 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 461 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  37.56 
 
 		 503 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  38.28 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  37.19 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  38.13 
 
 		 527 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6031  general substrate transporter  39.78 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  44.26 
 
 		 446 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  39.23 
 
 		 472 aa  305  8.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4657  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  37.99 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  38.95 
 
 		 493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5788  general substrate transporter  39.33 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.44 
 
 		 425 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  37.59 
 
 		 482 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  37.77 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  39.68 
 
 		 495 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  39.68 
 
 		 495 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  39.68 
 
 		 495 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  39.68 
 
 		 495 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  37.59 
 
 		 500 aa  299  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>