More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01920 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 449 aa  907    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  64.68 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  60.49 
 
 		 446 aa  553  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  51.93 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  51.83 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  49.89 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  51.13 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  48.34 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  48.58 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  48.1 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  48.43 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  51.71 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  46.08 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  42.72 
 
 		 430 aa  323  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  37.41 
 
 		 441 aa  319  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  40.04 
 
 		 493 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  39.39 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  37.84 
 
 		 495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  36.9 
 
 		 503 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  39.17 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  38.08 
 
 		 500 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  36.88 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  36.64 
 
 		 489 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  38.46 
 
 		 458 aa  296  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  36.56 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  36.32 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  38.21 
 
 		 495 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  36.32 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  38.21 
 
 		 495 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  36.32 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  38.21 
 
 		 495 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  38.21 
 
 		 495 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  36.32 
 
 		 493 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  37.44 
 
 		 467 aa  294  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  38.21 
 
 		 534 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  36.32 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  36.32 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  36.38 
 
 		 500 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  38.21 
 
 		 534 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  36.38 
 
 		 500 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  36.32 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  36.32 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  36.38 
 
 		 500 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  37.7 
 
 		 500 aa  293  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  36.32 
 
 		 485 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  35.83 
 
 		 496 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  36.38 
 
 		 552 aa  293  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 445 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 452 aa  292  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  36.8 
 
 		 483 aa  292  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  41.69 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  38.21 
 
 		 628 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  36.9 
 
 		 503 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  36.18 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  39.47 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  38.25 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  36.79 
 
 		 496 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  37.65 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  36.32 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  39.52 
 
 		 500 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  37.67 
 
 		 500 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  38.46 
 
 		 500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  36.79 
 
 		 527 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  39.52 
 
 		 500 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  37.11 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  36.19 
 
 		 500 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  36.19 
 
 		 500 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  37.74 
 
 		 626 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  37.12 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  37.12 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  38.12 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  38.46 
 
 		 481 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  35.73 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.73 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  35.51 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  35.73 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  35.73 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  35.73 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  36.88 
 
 		 489 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  38.19 
 
 		 460 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  38.19 
 
 		 460 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  38.19 
 
 		 460 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  36.32 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  37.42 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  39.23 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.25 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  37.42 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  37.42 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  36.87 
 
 		 530 aa  277  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  36.64 
 
 		 488 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  37.3 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  38.64 
 
 		 439 aa  275  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>