More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1907 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  100 
 
 		 454 aa  888    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  55.74 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  50 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  49.65 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  49.65 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  49.65 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  50.83 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  48.91 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  47.8 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  47.8 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  47.1 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  42.6 
 
 		 531 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  42.6 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 489 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  42.54 
 
 		 489 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  42.54 
 
 		 489 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  47.21 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  46.9 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  42.32 
 
 		 489 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  41.91 
 
 		 496 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  45.27 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  42.82 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  41.78 
 
 		 503 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  41.91 
 
 		 496 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  41.72 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  43.38 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  41 
 
 		 493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 467 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  42.56 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  41.23 
 
 		 527 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 495 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  41 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  42.09 
 
 		 488 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  39.77 
 
 		 500 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  42.25 
 
 		 452 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  42.25 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  40.44 
 
 		 503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  43.57 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  44.02 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  41.69 
 
 		 495 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  41.69 
 
 		 495 aa  336  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  41.69 
 
 		 495 aa  336  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  41.74 
 
 		 460 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  41.74 
 
 		 460 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  41.69 
 
 		 495 aa  336  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  41.74 
 
 		 460 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  41.69 
 
 		 534 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  41.69 
 
 		 534 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  41.69 
 
 		 628 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  38.96 
 
 		 500 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  38.55 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 454 aa  332  9e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  41.69 
 
 		 626 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  38.96 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  38.96 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  40.5 
 
 		 495 aa  330  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  41.69 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  37.7 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.51 
 
 		 445 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 445 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  43.99 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  43.29 
 
 		 456 aa  325  9e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  46.44 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  43.03 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 452 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  36.96 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  36.17 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  35.51 
 
 		 500 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  35.51 
 
 		 500 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  35.51 
 
 		 500 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  35.51 
 
 		 500 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  41.63 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  35.95 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.95 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  40.27 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  35.95 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  35.95 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  35.95 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  35.73 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  35.73 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  38.91 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  40.17 
 
 		 465 aa  312  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  37.64 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  39.81 
 
 		 440 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 445 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  37.77 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  38.12 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  37.27 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  42.34 
 
 		 461 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.52 
 
 		 430 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>