More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03982 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  100 
 
 		 500 aa  1015    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  100 
 
 		 500 aa  1015    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  82.7 
 
 		 500 aa  876    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  95.2 
 
 		 500 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  100 
 
 		 500 aa  1015    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  95.2 
 
 		 500 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  94.8 
 
 		 500 aa  979    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  99.8 
 
 		 500 aa  1013    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  83.3 
 
 		 500 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  91.8 
 
 		 500 aa  957    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  79.12 
 
 		 500 aa  831    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  99.4 
 
 		 500 aa  1012    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  100 
 
 		 500 aa  1015    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  95.2 
 
 		 500 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  75.7 
 
 		 500 aa  827    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  82.7 
 
 		 500 aa  878    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  99.4 
 
 		 500 aa  1012    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  83.7 
 
 		 500 aa  880    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1015    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  82.7 
 
 		 501 aa  860    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  49.07 
 
 		 503 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  50.85 
 
 		 496 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  50.87 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  49.69 
 
 		 503 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  51.17 
 
 		 527 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  50.32 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  48.73 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  48.52 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  51.37 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  50.87 
 
 		 491 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  51.37 
 
 		 628 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  50.64 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  51.37 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  51.37 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  51.37 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  51.37 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  51.37 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  51.94 
 
 		 626 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  52.39 
 
 		 495 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 489 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  49.45 
 
 		 552 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  48.73 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  48.73 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  48.52 
 
 		 489 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  47.61 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  49.57 
 
 		 489 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  51.33 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  47.52 
 
 		 493 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  43.06 
 
 		 530 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  48.17 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  43.2 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  43.2 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  43.2 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  43.2 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  43.2 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  43.2 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  43.2 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  42.13 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  43.2 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  43.42 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0518  General substrate transporter  42.83 
 
 		 526 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  43.31 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  42.5 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  42.5 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  42.5 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  43.18 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  41.94 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  46.57 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2166  General substrate transporter  45.82 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.734209 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  43.82 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  43.05 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18730  arabinose efflux permease family protein  44.78 
 
 		 480 aa  362  8e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.635364  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1065  major facilitator superfamily MFS_1  41.31 
 
 		 502 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.56 
 
 		 445 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 463 aa  350  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  40.5 
 
 		 441 aa  346  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  42.02 
 
 		 450 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6031  general substrate transporter  43.1 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5788  general substrate transporter  42.86 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  42.82 
 
 		 461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  39.11 
 
 		 465 aa  329  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  42.58 
 
 		 461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  42.58 
 
 		 461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0223  major facilitator family transporter  38.66 
 
 		 464 aa  323  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  39.37 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  40.63 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  39.37 
 
 		 445 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4685  proline/betaine transporter  84.86 
 
 		 261 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  38.91 
 
 		 441 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  41.22 
 
 		 436 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  41.22 
 
 		 436 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  41.22 
 
 		 436 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  36.58 
 
 		 472 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0596  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0610  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  41.53 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 467 aa  312  9e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  38.72 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  38.79 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>