More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0146 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  100 
 
 
431 aa  872    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  67.35 
 
 
446 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  64.68 
 
 
449 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  59.86 
 
 
436 aa  504  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  56.88 
 
 
467 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  54.03 
 
 
444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  54.08 
 
 
456 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  54.84 
 
 
444 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  54.84 
 
 
444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  54.59 
 
 
444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  54.86 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  52.26 
 
 
458 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  47.79 
 
 
436 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  43.61 
 
 
430 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  41.63 
 
 
445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  40.93 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  40.54 
 
 
485 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  40.54 
 
 
485 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  40.54 
 
 
485 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  40.54 
 
 
485 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  39.19 
 
 
441 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  40.54 
 
 
485 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  40.54 
 
 
485 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  40.29 
 
 
485 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  40.29 
 
 
485 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  40.29 
 
 
485 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  40 
 
 
444 aa  322  9.000000000000001e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  39.8 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  39.4 
 
 
458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  40.14 
 
 
493 aa  319  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  43.17 
 
 
445 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  42.68 
 
 
445 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  40.81 
 
 
440 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  36.38 
 
 
503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  40.19 
 
 
460 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  40.19 
 
 
460 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  40.19 
 
 
460 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  42.12 
 
 
445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  38.14 
 
 
482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  39.66 
 
 
452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  38.81 
 
 
453 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  37.05 
 
 
489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  37.05 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  37.39 
 
 
467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  37.3 
 
 
496 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  36.6 
 
 
493 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  38.06 
 
 
465 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  36.38 
 
 
503 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  36.17 
 
 
495 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  40.6 
 
 
445 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  35.92 
 
 
552 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  40.6 
 
 
445 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  36.82 
 
 
489 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  37.06 
 
 
496 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  36.82 
 
 
489 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 
443 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  37.29 
 
 
434 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  36.82 
 
 
489 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.79 
 
 
445 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  36.73 
 
 
491 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  37.59 
 
 
472 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  40.74 
 
 
481 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  39.44 
 
 
454 aa  295  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  36.58 
 
 
489 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  36.96 
 
 
452 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  36.13 
 
 
495 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  37.18 
 
 
530 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  41.91 
 
 
434 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  38.68 
 
 
461 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  36.6 
 
 
527 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  38.57 
 
 
461 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  38.57 
 
 
461 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  35.36 
 
 
500 aa  292  9e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  35.81 
 
 
501 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  35.35 
 
 
500 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  38.34 
 
 
461 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.15 
 
 
433 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  38.26 
 
 
450 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  35.36 
 
 
500 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  39.81 
 
 
445 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  39.81 
 
 
441 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  40.24 
 
 
436 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  40.24 
 
 
436 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 
443 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  40.24 
 
 
436 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  35.6 
 
 
500 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5748  general substrate transporter  40.61 
 
 
441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  34.74 
 
 
500 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  34.74 
 
 
500 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  38.01 
 
 
488 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  38.01 
 
 
489 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  34.66 
 
 
500 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  34.66 
 
 
500 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  34.66 
 
 
500 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  37.77 
 
 
454 aa  285  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  34.89 
 
 
500 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  34.89 
 
 
500 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6031  general substrate transporter  37.56 
 
 
461 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  34.66 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  39.34 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>