More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3365 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 433 aa  863    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  44.74 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 444 aa  332  9e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  41.15 
 
 		 444 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  41.26 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  38.59 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  38.55 
 
 		 531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1907  general substrate transporter  40 
 
 		 454 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  37.56 
 
 		 456 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  37.83 
 
 		 489 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 		 443 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 438 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  38.69 
 
 		 433 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  38.33 
 
 		 489 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  38.33 
 
 		 489 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  37.83 
 
 		 552 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  38.1 
 
 		 489 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  38.84 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  37.07 
 
 		 503 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  36.09 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  36.1 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  41.4 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  38.02 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  39.61 
 
 		 430 aa  294  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 447 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  36.72 
 
 		 503 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  36.1 
 
 		 491 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.86 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  37.15 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  36.09 
 
 		 496 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.15 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 426 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  38.77 
 
 		 445 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 495 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 445 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2084  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  36.45 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  38.35 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  36.45 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  35.76 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  35.63 
 
 		 527 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  35.98 
 
 		 500 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  36.21 
 
 		 500 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  34.35 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  37.26 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  37.77 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  36.23 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  41.5 
 
 		 436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0364  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  40.43 
 
 		 445 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  38.13 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  38.13 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  37.98 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  38.13 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  37.98 
 
 		 445 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  35.53 
 
 		 500 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  35.29 
 
 		 500 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  35.29 
 
 		 500 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  35.29 
 
 		 500 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  37.74 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  35.29 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  34.17 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  36.87 
 
 		 488 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  36.87 
 
 		 489 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  35.06 
 
 		 500 aa  279  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  35.06 
 
 		 500 aa  279  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 434 aa  279  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2986  general substrate transporter  36.04 
 
 		 449 aa  279  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  35.06 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  35.06 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  35.06 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>