More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  76.39 
 
 		 436 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  76.81 
 
 		 436 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  74.19 
 
 		 436 aa  634    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  100 
 
 		 439 aa  856    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  75.69 
 
 		 436 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  91.8 
 
 		 439 aa  770    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  69.93 
 
 		 440 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  69.93 
 
 		 438 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  71.7 
 
 		 433 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  52.72 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.7 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  51.53 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  51.53 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  54.48 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  51.3 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  54.23 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  54.23 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  54.23 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  53.19 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  53.98 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  54.23 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  51.3 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  54.23 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  50.57 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  54.23 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  51.3 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  50.24 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  52.55 
 
 		 461 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.18 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  48.12 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 436 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  47.43 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  48.92 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 431 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.62 
 
 		 425 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 425 aa  358  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  48.52 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 425 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 425 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 425 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 425 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  48.31 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 442 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  45.67 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 442 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  46.32 
 
 		 427 aa  346  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  47.36 
 
 		 428 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  48.32 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  47.36 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 428 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  42.76 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 444 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  44.17 
 
 		 499 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.52 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  43.33 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  43.21 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.39 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 440 aa  328  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  44.94 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  44.94 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  46.82 
 
 		 445 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 443 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 443 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 443 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  46.82 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  46.82 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  46.59 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  46.82 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  46.82 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 440 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  44.69 
 
 		 444 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 443 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 447 aa  322  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 449 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 466 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  43.63 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>