More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4149 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  100 
 
 		 433 aa  853    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  69.72 
 
 		 436 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  69.72 
 
 		 436 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  69.36 
 
 		 436 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  70.07 
 
 		 436 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  71.7 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  71.7 
 
 		 439 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  67.61 
 
 		 440 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  67.63 
 
 		 438 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.51 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  54.32 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  53.22 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  53.58 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  52.29 
 
 		 435 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  50.72 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  52.14 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  52.14 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  52.14 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  52.29 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  52.39 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  51.08 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  51.08 
 
 		 430 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  51.08 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  51.08 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  51.08 
 
 		 430 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  51.08 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  52.1 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 		 443 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 443 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  50.47 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  51.03 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.08 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  44.68 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  47.82 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  46.85 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 425 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 		 425 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.1 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  47.09 
 
 		 441 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 425 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 425 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 425 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 425 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  46.1 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 427 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 		 457 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 428 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 425 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  41.42 
 
 		 428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.4 
 
 		 454 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 428 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 439 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 		 444 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  42.17 
 
 		 453 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  44.3 
 
 		 499 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  46.29 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 449 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  42.38 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  44.22 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  44.22 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 443 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  44.17 
 
 		 445 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  42.75 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  42.65 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  42.75 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.07 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.3 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 443 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  43.06 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  44.17 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>