More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4720 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  81.25 
 
 		 433 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  880    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  81.35 
 
 		 445 aa  722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  80.9 
 
 		 445 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  81.12 
 
 		 445 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  99.32 
 
 		 443 aa  873    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  85.1 
 
 		 420 aa  715    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  81.35 
 
 		 445 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  80.9 
 
 		 445 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  94.58 
 
 		 443 aa  833    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  95.26 
 
 		 443 aa  842    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  90.29 
 
 		 440 aa  789    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  94.81 
 
 		 443 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  94.58 
 
 		 443 aa  833    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  50.99 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  50.12 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  45.02 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 437 aa  359  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  47 
 
 		 438 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 438 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  47.83 
 
 		 447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  45 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 440 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 448 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 439 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 433 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  46.32 
 
 		 437 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  46.32 
 
 		 437 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  49.03 
 
 		 434 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 442 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  45.37 
 
 		 438 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.82 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  43.49 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  43.49 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  43.49 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  43.76 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  44.24 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  44.24 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  43.52 
 
 		 430 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  43.76 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  43.76 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  45.22 
 
 		 437 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  44.66 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  44.2 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  45.99 
 
 		 438 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  43.41 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  44.74 
 
 		 435 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.24 
 
 		 430 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 437 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  49.03 
 
 		 426 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  49.03 
 
 		 426 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  49.03 
 
 		 426 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 425 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 425 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 425 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  45.8 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  42.95 
 
 		 441 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  42.95 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  43.59 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  42.51 
 
 		 430 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  43.98 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 463 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  44.86 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  44.29 
 
 		 439 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  44.33 
 
 		 425 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 433 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.43 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 535 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>