More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1824 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  100 
 
 		 448 aa  887    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  84.79 
 
 		 453 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  83.22 
 
 		 466 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  54.18 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  53.14 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  52.56 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  52.02 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  50.44 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  52.02 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  51.07 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  50.11 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  50.11 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  50.56 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  50.33 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  49.67 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  49.67 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  47.97 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  46.61 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  46.03 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  47.14 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  46.03 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  44.1 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  44.1 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  44.1 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  44.1 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  44.1 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  44.63 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.5 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 461 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 447 aa  362  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  43.45 
 
 		 438 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  46.07 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 		 438 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 438 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 438 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  43.82 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 463 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 428 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 428 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  42.93 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  42.72 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  42.72 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  42.72 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  42.83 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 440 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 426 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 426 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 426 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  42.45 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  42.45 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  42.08 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  42.18 
 
 		 430 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  42.18 
 
 		 430 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  42.18 
 
 		 430 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  42.18 
 
 		 430 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  42.18 
 
 		 430 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  43.27 
 
 		 417 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 440 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  41.44 
 
 		 434 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.3 
 
 		 430 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  42.82 
 
 		 438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.75 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5425  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 		 438 aa  329  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.460942  normal  0.126626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  39.45 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 428 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  41.79 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  42.96 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>