More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6354 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  874    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  87.25 
 
 		 445 aa  743    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  67.29 
 
 		 439 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  65.89 
 
 		 439 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  66.03 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  46.68 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  44.29 
 
 		 437 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  44.5 
 
 		 437 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.42 
 
 		 437 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 437 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 439 aa  329  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 445 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 445 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 445 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 445 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  41.3 
 
 		 420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 		 443 aa  319  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 430 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 438 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 443 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 443 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  40.19 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  42.03 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.05 
 
 		 435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.44 
 
 		 430 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  43.61 
 
 		 434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  40.19 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  41.03 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 436 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  40.05 
 
 		 435 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  39.8 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  39.8 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  39.8 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  39.01 
 
 		 435 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  39.01 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  39.29 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  39.42 
 
 		 438 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 438 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  39.05 
 
 		 430 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  39.05 
 
 		 430 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  39.05 
 
 		 430 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  39.05 
 
 		 430 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  39.05 
 
 		 430 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 417 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  39.28 
 
 		 436 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 440 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 535 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 		 427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  38.43 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 436 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  39.44 
 
 		 429 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.75 
 
 		 437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5623  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.06 
 
 		 431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.75 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5425  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.460942  normal  0.126626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 435 aa  282  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 436 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>