More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4765 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  84.4 
 
 		 433 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  817    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  83.49 
 
 		 430 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  817    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  817    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  58.23 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  53.24 
 
 		 463 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  50 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  50 
 
 		 443 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  50 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  48.18 
 
 		 434 aa  356  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  50.74 
 
 		 434 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 443 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  48.54 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 443 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  47.24 
 
 		 437 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  47.24 
 
 		 437 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  44.85 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 466 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  49.06 
 
 		 445 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  46.58 
 
 		 437 aa  345  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 448 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  49.06 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  48.82 
 
 		 445 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  48.82 
 
 		 445 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  48.79 
 
 		 440 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  48.82 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  48.82 
 
 		 420 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  46.06 
 
 		 437 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  47.17 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  46.78 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 433 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 433 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 535 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 435 aa  315  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  44.73 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  44.86 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  44.86 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  44.39 
 
 		 435 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  44.39 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  44.39 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  45.82 
 
 		 430 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  43.9 
 
 		 430 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  43.9 
 
 		 430 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  43.9 
 
 		 430 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  43.9 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  43.9 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  43.9 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  44.2 
 
 		 417 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.41 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 436 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  42 
 
 		 438 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  42 
 
 		 438 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  42.86 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 438 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 442 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  42.46 
 
 		 438 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 438 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 431 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.62 
 
 		 430 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  43.72 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5425  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.460942  normal  0.126626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  42 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  43.1 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2288  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.78 
 
 		 429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0638565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 438 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  41.31 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.51 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 425 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  38.82 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  42.48 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>