More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1763 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  75.93 
 
 
428 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  76.17 
 
 
428 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  76.64 
 
 
428 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
427 aa  843    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  75.7 
 
 
428 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  75.47 
 
 
428 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  76.17 
 
 
428 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  75.7 
 
 
428 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  61.56 
 
 
440 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  59.53 
 
 
425 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  58.77 
 
 
452 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  58.52 
 
 
425 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  58.52 
 
 
435 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  57.88 
 
 
429 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  58.06 
 
 
413 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  58.06 
 
 
413 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  57.52 
 
 
425 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  58.45 
 
 
425 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  57.76 
 
 
425 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  59.8 
 
 
425 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  57.76 
 
 
425 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  57.76 
 
 
425 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  57.28 
 
 
425 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  59.31 
 
 
425 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  57.97 
 
 
425 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  57.66 
 
 
427 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  55.19 
 
 
431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  56.6 
 
 
499 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  55.9 
 
 
438 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  55.04 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 
424 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  52.94 
 
 
425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  53.29 
 
 
442 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  51.83 
 
 
457 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.41 
 
 
454 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
438 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  50.91 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 
443 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  48.82 
 
 
436 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  48.02 
 
 
461 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  47.94 
 
 
443 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.84 
 
 
430 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  47.18 
 
 
438 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.57 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  46.15 
 
 
447 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  46.37 
 
 
435 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  46.37 
 
 
435 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  46.37 
 
 
435 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  46.6 
 
 
435 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  46.37 
 
 
435 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  46.37 
 
 
435 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  47.76 
 
 
440 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  46.37 
 
 
435 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  45.18 
 
 
438 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  45.18 
 
 
438 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  46.93 
 
 
430 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  47.12 
 
 
430 aa  362  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  44.94 
 
 
438 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  47.47 
 
 
430 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  47.47 
 
 
430 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  47.47 
 
 
430 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  47.47 
 
 
430 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  47.47 
 
 
430 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  47.47 
 
 
430 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  45.48 
 
 
448 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  48.14 
 
 
417 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  44.15 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  46.37 
 
 
453 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  45.24 
 
 
437 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  46.06 
 
 
437 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  46.06 
 
 
437 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.15 
 
 
438 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  45.21 
 
 
466 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  45.11 
 
 
428 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  45.67 
 
 
439 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  45.57 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  45.88 
 
 
437 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  47.73 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  44.05 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  44.95 
 
 
439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  44.06 
 
 
438 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  44.47 
 
 
431 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  47.42 
 
 
434 aa  332  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
434 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  44.52 
 
 
441 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
434 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  45.74 
 
 
439 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  44.15 
 
 
441 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  44.15 
 
 
441 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  45.04 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  43.91 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  44.17 
 
 
440 aa  326  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  41.79 
 
 
436 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
452 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  41.67 
 
 
436 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.38 
 
 
452 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  44.12 
 
 
433 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  46.21 
 
 
445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  46.21 
 
 
445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>