More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3049 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  98.38 
 
 		 535 aa  849    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  94.44 
 
 		 433 aa  797    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  865    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  84.53 
 
 		 433 aa  745    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  48.84 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 433 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  45.15 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2288  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.23 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0638565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 438 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  44.66 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  44.42 
 
 		 445 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  44.42 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  44.42 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  44.42 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  44.72 
 
 		 420 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 443 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 443 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 448 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 443 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 443 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 447 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 425 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  42.13 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.95 
 
 		 435 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.89 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  41.99 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  41.99 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  41.65 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  40.52 
 
 		 440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  41.93 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  41.26 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  41.69 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  44.1 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  40.85 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  41.26 
 
 		 435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  40.85 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  41.03 
 
 		 430 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  40.85 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  40.85 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  40.85 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  41.26 
 
 		 435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  41.12 
 
 		 430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.02 
 
 		 425 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  41.26 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  42.41 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.7 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  43.27 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  40.38 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  42.37 
 
 		 430 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  44.91 
 
 		 427 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  40.42 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 440 aa  292  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  41.27 
 
 		 439 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 436 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  43 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  41.15 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  40.15 
 
 		 438 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>