More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0294 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  87.3 
 
 
441 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  98.86 
 
 
437 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  87.07 
 
 
441 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  99.54 
 
 
437 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  86.62 
 
 
441 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  87.7 
 
 
439 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  86.62 
 
 
441 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  96.11 
 
 
437 aa  823    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
437 aa  854    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  87.87 
 
 
437 aa  739    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  86.39 
 
 
441 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1246  putative transporter  98.83 
 
 
256 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0959  major facilitator family protein  98.83 
 
 
256 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  51.22 
 
 
448 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  51.64 
 
 
438 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  52.61 
 
 
440 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  51.64 
 
 
438 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  50.44 
 
 
466 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  51.47 
 
 
439 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  50.11 
 
 
453 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  50.84 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  50.45 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 
443 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  49.39 
 
 
440 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  47.42 
 
 
431 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 
443 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.97 
 
 
435 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  46.21 
 
 
437 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  47.02 
 
 
461 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  46.3 
 
 
445 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  46.3 
 
 
445 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  46.3 
 
 
445 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  46.3 
 
 
445 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  46.3 
 
 
445 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
434 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
434 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  46.84 
 
 
434 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  44.05 
 
 
438 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  45.73 
 
 
443 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  46.08 
 
 
440 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  45.6 
 
 
443 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  44.05 
 
 
438 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  46.38 
 
 
420 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  44.63 
 
 
442 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 
433 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  44.52 
 
 
438 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  45.73 
 
 
443 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  46.06 
 
 
443 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  46.06 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  46.06 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  43.81 
 
 
438 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  46.44 
 
 
436 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  45.39 
 
 
442 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  48.33 
 
 
430 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  45.52 
 
 
438 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  48.57 
 
 
433 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  46.94 
 
 
428 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.05 
 
 
438 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  45.07 
 
 
447 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  46.42 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  46.42 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  46.42 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  46.42 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  44.02 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  46.42 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  46.42 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  45.91 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  46.42 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  46.45 
 
 
428 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 
438 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  45.7 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  46.21 
 
 
428 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  45.97 
 
 
428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.86 
 
 
430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  46.21 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  46.21 
 
 
428 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  45.97 
 
 
428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  45.21 
 
 
435 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  44.72 
 
 
435 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  44.47 
 
 
435 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  43.79 
 
 
445 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  44.47 
 
 
435 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  44.72 
 
 
435 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  44.72 
 
 
435 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  44.17 
 
 
431 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  47.24 
 
 
426 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  47.24 
 
 
426 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  47.24 
 
 
426 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  43.03 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  44.28 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  43.78 
 
 
425 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  44.04 
 
 
425 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  44.28 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  44.28 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  44.28 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  46.59 
 
 
473 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  43.13 
 
 
440 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>