More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4434 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  97.96 
 
 		 441 aa  810    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  96.15 
 
 		 441 aa  791    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  96.15 
 
 		 441 aa  791    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  88.21 
 
 		 437 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  93.2 
 
 		 437 aa  785    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  95.46 
 
 		 439 aa  790    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  88.21 
 
 		 437 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  87.53 
 
 		 437 aa  762    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  867    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  87.76 
 
 		 437 aa  738    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  95.92 
 
 		 441 aa  788    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1246  putative transporter  85.27 
 
 		 256 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0959  major facilitator family protein  85.27 
 
 		 256 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  50.89 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  51.13 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 466 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  49.53 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  48.09 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  47.02 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.32 
 
 		 435 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 434 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 438 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  46.63 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 442 aa  350  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 443 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 443 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  46.29 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  46.39 
 
 		 430 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 437 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 433 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  44 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  44.18 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  45.71 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  44.14 
 
 		 445 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  44.14 
 
 		 445 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 447 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  44.14 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  44.14 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  44.14 
 
 		 445 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 443 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  44.89 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 442 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  43.94 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  44.5 
 
 		 420 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 		 438 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  44.53 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  44.28 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  44.28 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.72 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  44.04 
 
 		 435 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  44.04 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 428 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 440 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 		 429 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 428 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 428 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  43.2 
 
 		 430 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  45.41 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  44.05 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  44.28 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>