More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3084 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  94.44 
 
 		 535 aa  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  863    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  94.44 
 
 		 433 aa  816    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  85.88 
 
 		 433 aa  753    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  51.09 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 430 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  45.32 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 434 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  44.71 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2288  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.04 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0638565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 438 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  47.17 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  47.17 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  47.17 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 433 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  43.51 
 
 		 445 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  43.28 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  43.28 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  43.28 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  43.28 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  44.5 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  42.76 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 443 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 443 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  42.48 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  41.99 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  42.24 
 
 		 437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.9 
 
 		 435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.61 
 
 		 430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 430 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 430 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 430 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 417 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  41.75 
 
 		 435 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 463 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  41.75 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  42.13 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  42 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  41.75 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  40.57 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.16 
 
 		 454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  41.02 
 
 		 435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  41.02 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  41.02 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 		 457 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  42.89 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.54 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 438 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 436 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  41.08 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  39.91 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  40.73 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 425 aa  296  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 425 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 428 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  44.67 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  41.35 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>