More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3314 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
457 aa  909    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  94.97 
 
 
454 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  70.79 
 
 
438 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  70.79 
 
 
438 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  52.44 
 
 
425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  51.83 
 
 
427 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.67 
 
 
425 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  52.91 
 
 
425 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  49.67 
 
 
443 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  51.65 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  51.18 
 
 
425 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  50.71 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  50.71 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  50.71 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  50.94 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  49.43 
 
 
428 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  50.95 
 
 
427 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  49.1 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  50.98 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  49.89 
 
 
428 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  49.66 
 
 
428 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  50.48 
 
 
499 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
443 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  49.43 
 
 
428 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  49.2 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  48.93 
 
 
429 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  45.64 
 
 
440 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  48.63 
 
 
428 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  50.37 
 
 
461 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  48.63 
 
 
428 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  46.01 
 
 
452 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 
444 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  46.01 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  45.6 
 
 
435 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  45.6 
 
 
435 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  46.01 
 
 
425 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  45.62 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  45.62 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  45.39 
 
 
435 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 
425 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  45.39 
 
 
435 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  47.64 
 
 
435 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  46.81 
 
 
447 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.48 
 
 
435 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.31 
 
 
430 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  46.01 
 
 
430 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  46.44 
 
 
430 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  45.65 
 
 
413 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  45.65 
 
 
413 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  45.15 
 
 
440 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  46.53 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  46.53 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  46.53 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  46.53 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  46.53 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  46.53 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  47.72 
 
 
417 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  47.86 
 
 
431 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
424 aa  358  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  45.94 
 
 
438 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  44.62 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  44.62 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  44.39 
 
 
438 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  45.18 
 
 
438 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  44.9 
 
 
431 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  43.93 
 
 
436 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  44.5 
 
 
436 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  43.96 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  43.66 
 
 
436 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  43.36 
 
 
438 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  42.92 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 
438 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40 
 
 
452 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  43.29 
 
 
439 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  42.92 
 
 
439 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  39.03 
 
 
452 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  44.73 
 
 
440 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  40.05 
 
 
448 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  43.61 
 
 
433 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  41.11 
 
 
440 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 
439 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  42.05 
 
 
438 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  43.02 
 
 
443 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  43.02 
 
 
443 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  38.81 
 
 
449 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  43.02 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  43.44 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  43.17 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  42.73 
 
 
443 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
445 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  40.94 
 
 
431 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
445 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
420 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
445 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  42.07 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  42.72 
 
 
445 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  41.41 
 
 
442 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  39.4 
 
 
466 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>