More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5373 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  80.45 
 
 
445 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  100 
 
 
443 aa  879    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  80.9 
 
 
445 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  99.32 
 
 
443 aa  872    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  84.62 
 
 
420 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  95.26 
 
 
443 aa  840    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  80.67 
 
 
445 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  80.9 
 
 
445 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  80.45 
 
 
445 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  96.61 
 
 
443 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  94.58 
 
 
443 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  92.78 
 
 
440 aa  800    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  79.31 
 
 
433 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  100 
 
 
443 aa  879    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  50.83 
 
 
440 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  47.32 
 
 
443 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
434 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  45.52 
 
 
453 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
434 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 
443 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  49.26 
 
 
431 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  49.39 
 
 
434 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  43.36 
 
 
466 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  48.67 
 
 
430 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  47.24 
 
 
438 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  48.55 
 
 
433 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  48.31 
 
 
447 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  47.24 
 
 
438 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  44.52 
 
 
448 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  45.94 
 
 
439 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  45.41 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  49.52 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  45.58 
 
 
437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  46.89 
 
 
442 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  46.45 
 
 
461 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  48.93 
 
 
434 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  46.08 
 
 
437 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  46.08 
 
 
437 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  45.73 
 
 
430 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 
438 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 
438 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  43.1 
 
 
437 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  44.08 
 
 
430 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  45.41 
 
 
440 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  44.77 
 
 
435 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  44.08 
 
 
430 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  44.24 
 
 
435 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  44.08 
 
 
430 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  43.98 
 
 
430 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  44.26 
 
 
417 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  44.21 
 
 
435 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  43.85 
 
 
430 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  43.85 
 
 
430 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  44.28 
 
 
435 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  44.28 
 
 
435 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  46.23 
 
 
436 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  44.21 
 
 
435 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  44.28 
 
 
435 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  44.98 
 
 
437 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.11 
 
 
435 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  45.74 
 
 
438 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.06 
 
 
438 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  43.05 
 
 
438 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  45.71 
 
 
437 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.72 
 
 
430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  50 
 
 
426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  42.6 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  50 
 
 
426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  43.09 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  50 
 
 
426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  43.09 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  45.63 
 
 
439 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  44.78 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  44.78 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  45.41 
 
 
425 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  45.41 
 
 
425 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  44.71 
 
 
441 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  45.41 
 
 
425 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  45.81 
 
 
425 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  44.55 
 
 
441 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  44.47 
 
 
441 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  44.23 
 
 
473 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  45.17 
 
 
425 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  44.69 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  46.65 
 
 
463 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  42.05 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  45.18 
 
 
439 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  42.72 
 
 
431 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  43 
 
 
430 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  39.63 
 
 
442 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  44.44 
 
 
425 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  44.71 
 
 
427 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  45.52 
 
 
439 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  44.33 
 
 
425 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  42.79 
 
 
433 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 
457 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.33 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  43.46 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  43.46 
 
 
428 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>