More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2550 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  872    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  95.18 
 
 		 436 aa  838    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  93.81 
 
 		 436 aa  822    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  93.12 
 
 		 436 aa  819    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  76.81 
 
 		 439 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  75 
 
 		 439 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  69.72 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  66.43 
 
 		 440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  68.45 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  51.67 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.48 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  50.72 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  51.6 
 
 		 430 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  52.11 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  52.11 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  52.11 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  52.11 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  52.11 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  50.74 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  52.11 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  52.11 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  48.47 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  48.66 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  50 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  49.75 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  49.75 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  49.75 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  49.26 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  48.22 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  49.26 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  46 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 438 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 438 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.19 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  44.94 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 436 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.52 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 457 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 425 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.5 
 
 		 454 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  44.5 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  43.66 
 
 		 427 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.66 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  45.66 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  41.83 
 
 		 428 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 427 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  44.19 
 
 		 499 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 449 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 440 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.52 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 428 aa  312  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  40.29 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  41.55 
 
 		 429 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 443 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 433 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 440 aa  309  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  41.71 
 
 		 444 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  41 
 
 		 435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 535 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  40.15 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>