More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3376 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  84.54 
 
 		 425 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  84.54 
 
 		 425 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  100 
 
 		 499 aa  975    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  83.61 
 
 		 425 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  76.58 
 
 		 425 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  94.61 
 
 		 427 aa  772    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  84.54 
 
 		 425 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  84.54 
 
 		 425 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  84.54 
 
 		 425 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  84.54 
 
 		 425 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  78.48 
 
 		 425 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  74.12 
 
 		 425 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  56.6 
 
 		 427 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  55.96 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  52.74 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  54.1 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  53.86 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  53.86 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  55.32 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  55.01 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  53.15 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  50.24 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.23 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  50.24 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  50.37 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  50.37 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  49.43 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  51.04 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  50.47 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  52.52 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  48.46 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  51.22 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  48.78 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  50 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  48.54 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  49.64 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  48.78 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  48.91 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  48.98 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.06 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  48.98 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.85 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  46.23 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  49.23 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  49.24 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  46.31 
 
 		 440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3332  major facilitator superfamily permease  93.03 
 
 		 204 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2569  hypothetical protein  92.04 
 
 		 207 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0299  hypothetical protein  92.04 
 
 		 207 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2383  hypothetical protein  92.04 
 
 		 204 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1161  hypothetical protein  92.04 
 
 		 204 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.372975  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  48.6 
 
 		 441 aa  336  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3366  hypothetical protein  93.53 
 
 		 204 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  44.03 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 440 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  44.03 
 
 		 439 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  43.87 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  45.77 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 442 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  43.34 
 
 		 436 aa  322  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  45.14 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  43.72 
 
 		 430 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 435 aa  317  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  42.72 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.12 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  44.5 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  43.93 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  44 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.36 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.24 
 
 		 452 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  43.69 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  42.99 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>