More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3017 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  92.5 
 
 
440 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  92.5 
 
 
440 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  100 
 
 
440 aa  876    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  66.99 
 
 
447 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  50.69 
 
 
443 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
443 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  49.88 
 
 
461 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  47.16 
 
 
447 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.03 
 
 
435 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  45.2 
 
 
438 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  44.09 
 
 
438 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  45.2 
 
 
438 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  44.32 
 
 
438 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  45.54 
 
 
431 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.74 
 
 
438 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  44.06 
 
 
435 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.5 
 
 
430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  43.74 
 
 
435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  43.74 
 
 
435 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  44.63 
 
 
440 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  43.5 
 
 
435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  43.5 
 
 
435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  43.5 
 
 
435 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  43.95 
 
 
430 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  44.34 
 
 
430 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  44.58 
 
 
430 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  44.34 
 
 
430 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  44.58 
 
 
430 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  44.34 
 
 
430 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  44.34 
 
 
430 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  45.22 
 
 
417 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  43.36 
 
 
435 aa  348  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  41.59 
 
 
436 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  43.14 
 
 
438 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  44.98 
 
 
430 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  44.47 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  43.71 
 
 
436 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  44.42 
 
 
439 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  43.19 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  43.06 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  43.31 
 
 
440 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  44.73 
 
 
425 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 
438 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  44.5 
 
 
425 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  44.77 
 
 
425 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  44.77 
 
 
425 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  44.77 
 
 
425 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  44.77 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  44.77 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  43.2 
 
 
439 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  44.28 
 
 
427 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
438 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  40.47 
 
 
442 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  41.81 
 
 
438 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  39.56 
 
 
428 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.34 
 
 
425 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  42.08 
 
 
444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.34 
 
 
454 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  43.41 
 
 
499 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 
425 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 
427 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  43.95 
 
 
441 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 
457 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  42.17 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  40.19 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  43.97 
 
 
425 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  41.23 
 
 
440 aa  312  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  39.95 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  39.95 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  40.66 
 
 
428 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  41.71 
 
 
437 aa  309  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  38.44 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  39.24 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  38.21 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  38.55 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  41.45 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  41.45 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  39.46 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
444 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  38.48 
 
 
413 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  38.48 
 
 
413 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 
425 aa  298  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  37.71 
 
 
437 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  40.47 
 
 
431 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  42.04 
 
 
431 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  40.72 
 
 
437 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 
424 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  40.19 
 
 
428 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  40.43 
 
 
428 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  40 
 
 
434 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
438 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  38.98 
 
 
445 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  40.33 
 
 
437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  39.13 
 
 
445 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  39.9 
 
 
444 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  36.93 
 
 
453 aa  286  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  36.38 
 
 
466 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  39.44 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  39.08 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>