More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0389 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  83.02 
 
 		 435 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  82.42 
 
 		 435 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  83.25 
 
 		 435 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  83.37 
 
 		 435 aa  696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  79.43 
 
 		 430 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  79.95 
 
 		 417 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  85.78 
 
 		 440 aa  734    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  83.37 
 
 		 435 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  79.43 
 
 		 430 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  79.43 
 
 		 430 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  82.9 
 
 		 435 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  79.1 
 
 		 430 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  79.43 
 
 		 430 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  94.65 
 
 		 430 aa  801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  100 
 
 		 430 aa  838    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  79.43 
 
 		 430 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  83.25 
 
 		 435 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  79.43 
 
 		 430 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  51.57 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  51.1 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  53.05 
 
 		 439 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  50.72 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  53.19 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  53.53 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  51.4 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  51.34 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  50.49 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  53.22 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 438 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  51.39 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  50.49 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  49.17 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  49.27 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.15 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 431 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 		 438 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  48.69 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.47 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  48.81 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  50.49 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  48.76 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  48.89 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.68 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  48.76 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  49.23 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  48.72 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  47.12 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  47.7 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  47.96 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 447 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 440 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 440 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 428 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  44.12 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  42.25 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  48.35 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 439 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  43 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  46.92 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  45.93 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  46.02 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  44.12 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 440 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.48 
 
 		 440 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 439 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  44.2 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  43.13 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  43.13 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  43.13 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  42.89 
 
 		 453 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  44.2 
 
 		 435 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  44.2 
 
 		 425 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  43 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  43 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>