More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1589 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  92.76 
 
 
428 aa  772    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  99.53 
 
 
428 aa  839    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  92.99 
 
 
428 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  75.93 
 
 
427 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  100 
 
 
428 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  92.99 
 
 
428 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  97.2 
 
 
428 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  99.53 
 
 
428 aa  839    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  62.32 
 
 
440 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  60.69 
 
 
429 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  54.03 
 
 
435 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  54.28 
 
 
452 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  55.63 
 
 
425 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  54.86 
 
 
425 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  55.37 
 
 
425 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  55.82 
 
 
425 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  55.37 
 
 
425 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  55.84 
 
 
425 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.37 
 
 
425 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  55.84 
 
 
425 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  55.84 
 
 
425 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  55.37 
 
 
425 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  54.8 
 
 
413 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  54.8 
 
 
413 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  56.53 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  56.45 
 
 
427 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  55.34 
 
 
425 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  54.93 
 
 
424 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  54.01 
 
 
425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  53.86 
 
 
499 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  54.66 
 
 
438 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  54.41 
 
 
438 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  52.12 
 
 
442 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  49.2 
 
 
457 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.31 
 
 
454 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 
438 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 
443 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
444 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 
443 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  47.79 
 
 
461 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  49.41 
 
 
436 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  46.89 
 
 
447 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.79 
 
 
435 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  46.41 
 
 
438 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  45.92 
 
 
438 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  45.92 
 
 
438 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  47.07 
 
 
438 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  46.41 
 
 
438 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  46.57 
 
 
438 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  46.54 
 
 
435 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  46.54 
 
 
435 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  46.3 
 
 
435 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  46.3 
 
 
435 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  46.06 
 
 
435 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  48.78 
 
 
430 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  46.06 
 
 
435 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  48.78 
 
 
430 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  48.78 
 
 
430 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  48.78 
 
 
430 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  48.78 
 
 
430 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  46.3 
 
 
435 aa  358  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  48.78 
 
 
417 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  48.66 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  47.22 
 
 
440 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  48.14 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.78 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  47.36 
 
 
439 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  45.81 
 
 
437 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  45.81 
 
 
437 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  45.48 
 
 
437 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  47.37 
 
 
439 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  45.57 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  46.53 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  44.19 
 
 
448 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  43.54 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  43.69 
 
 
428 aa  336  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  47 
 
 
442 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  45.19 
 
 
440 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  44.13 
 
 
453 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  43.32 
 
 
466 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  41.14 
 
 
452 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 
440 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  43.75 
 
 
438 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  46 
 
 
445 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  43.75 
 
 
431 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  44.16 
 
 
437 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
445 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
420 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  41.87 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  44.47 
 
 
440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  45.26 
 
 
439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.96 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  43.72 
 
 
441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  42.52 
 
 
443 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 
433 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.44 
 
 
443 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  42.29 
 
 
443 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>