More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4993 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  77.49 
 
 
447 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  100 
 
 
438 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  92.92 
 
 
438 aa  821    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  92.47 
 
 
438 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  92.47 
 
 
438 aa  816    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  81.48 
 
 
435 aa  700    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  92.47 
 
 
438 aa  815    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  65.53 
 
 
438 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  64.81 
 
 
436 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  68.06 
 
 
431 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  58.85 
 
 
443 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  60.61 
 
 
461 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  59.81 
 
 
443 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  57.99 
 
 
441 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  55.94 
 
 
444 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  54.43 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  51.07 
 
 
435 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  51.07 
 
 
435 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  51.72 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  51.72 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  51.72 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  50.35 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  51.72 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  51.08 
 
 
417 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  50.24 
 
 
430 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  50.24 
 
 
430 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  50.47 
 
 
430 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  50.95 
 
 
430 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  50.47 
 
 
430 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  50.47 
 
 
430 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  51.72 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  49.31 
 
 
438 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  48.96 
 
 
438 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  48.17 
 
 
440 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  48.8 
 
 
425 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  49.51 
 
 
425 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  49.04 
 
 
425 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.56 
 
 
425 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.65 
 
 
430 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  49.39 
 
 
425 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  49.62 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  49.87 
 
 
425 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  49.62 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  48.18 
 
 
439 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  49.62 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  49.62 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  47.85 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  46.95 
 
 
440 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  48.77 
 
 
499 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  46.01 
 
 
438 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  50.88 
 
 
427 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  45.2 
 
 
442 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  46.96 
 
 
439 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  46.81 
 
 
428 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  46.57 
 
 
428 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  46.43 
 
 
428 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  46.34 
 
 
428 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 
457 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  47.83 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  47.51 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  47.83 
 
 
428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  44.74 
 
 
440 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  45.17 
 
 
436 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  45.17 
 
 
436 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
427 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  44.69 
 
 
436 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.34 
 
 
454 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 
444 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  44.87 
 
 
437 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  44.02 
 
 
436 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  45.05 
 
 
443 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  43.33 
 
 
437 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  46.56 
 
 
433 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  44.09 
 
 
443 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  44.09 
 
 
443 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  44.04 
 
 
437 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.04 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.11 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  44.55 
 
 
443 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  44.71 
 
 
443 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.48 
 
 
440 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  45.48 
 
 
440 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  41.87 
 
 
437 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  43.68 
 
 
453 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  44.44 
 
 
443 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  44.88 
 
 
448 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  45.17 
 
 
447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  44.04 
 
 
437 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  44.64 
 
 
440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  43.15 
 
 
466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  44.37 
 
 
437 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 
439 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
429 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
433 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 
439 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  45.91 
 
 
440 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  44.68 
 
 
442 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  44.68 
 
 
441 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  43.02 
 
 
445 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  43.02 
 
 
445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>