More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2954 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  83.22 
 
 
448 aa  690    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  100 
 
 
466 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  92.27 
 
 
453 aa  813    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  52.35 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  50.65 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  50.9 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  51.27 
 
 
437 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  51.27 
 
 
437 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  50.22 
 
 
437 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  50.35 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  51.03 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  49.56 
 
 
441 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  49.34 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  48.52 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  50.34 
 
 
441 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  50.34 
 
 
441 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  46.98 
 
 
442 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  49.12 
 
 
439 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  50.11 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 
433 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  46.54 
 
 
434 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  48.05 
 
 
438 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  48.05 
 
 
438 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  44.84 
 
 
431 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  47.32 
 
 
445 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  47.28 
 
 
440 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 
443 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  44.39 
 
 
437 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 
434 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 
434 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  44.83 
 
 
445 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  44.83 
 
 
420 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  44.83 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  44.83 
 
 
445 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  43.36 
 
 
443 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.89 
 
 
443 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  44.57 
 
 
440 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  44.83 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  44.83 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  43.36 
 
 
443 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  43.52 
 
 
443 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  43.36 
 
 
443 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 
443 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  43.3 
 
 
443 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  44.49 
 
 
430 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 
427 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  41.98 
 
 
461 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  45.03 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  42.12 
 
 
447 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.96 
 
 
435 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 
438 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
438 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  42.95 
 
 
435 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  42.95 
 
 
435 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  42.79 
 
 
430 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  43.74 
 
 
438 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  43.51 
 
 
438 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  43.51 
 
 
438 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  42.4 
 
 
435 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  42.41 
 
 
430 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  42.4 
 
 
435 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  42.41 
 
 
430 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  42.4 
 
 
435 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  43.28 
 
 
438 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  42.4 
 
 
430 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  42.4 
 
 
430 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  42.4 
 
 
430 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  42.4 
 
 
430 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  43.15 
 
 
438 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.03 
 
 
430 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  43.02 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  42.5 
 
 
435 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  42.5 
 
 
435 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  41.45 
 
 
442 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  42.55 
 
 
440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  45.33 
 
 
426 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  45.33 
 
 
426 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  45.33 
 
 
426 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  43.38 
 
 
428 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  41.39 
 
 
434 aa  336  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  43.71 
 
 
463 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  43.03 
 
 
430 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  42.3 
 
 
440 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  41.23 
 
 
438 aa  332  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  43.55 
 
 
428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  43.31 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  39.87 
 
 
440 aa  329  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  43.32 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  41.97 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  43.32 
 
 
428 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  41.44 
 
 
439 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  41.7 
 
 
425 aa  326  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  43.16 
 
 
438 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 
424 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5425  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
438 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.460942  normal  0.126626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  41.18 
 
 
431 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  40.47 
 
 
436 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  42.13 
 
 
427 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  41.18 
 
 
433 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  40.84 
 
 
436 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>