More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5425 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5425  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
438 aa  868    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.460942  normal  0.126626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  42.24 
 
 
448 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  40.67 
 
 
466 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 
439 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  40.58 
 
 
453 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 
439 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  41.43 
 
 
437 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  41.81 
 
 
432 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
437 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  41 
 
 
443 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  40.76 
 
 
443 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  41.23 
 
 
443 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  41.23 
 
 
443 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  40.95 
 
 
443 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  41.23 
 
 
443 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  42.03 
 
 
437 aa  293  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  41 
 
 
440 aa  292  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 
433 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  39.58 
 
 
437 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  41.05 
 
 
437 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
434 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  38.43 
 
 
434 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  37.77 
 
 
434 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  37.47 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  38.88 
 
 
438 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  41.35 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  38.64 
 
 
438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  38.46 
 
 
442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  41.2 
 
 
433 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
445 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  41.57 
 
 
439 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  37.36 
 
 
437 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
445 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
445 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
420 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  40.46 
 
 
441 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  40.18 
 
 
441 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
445 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
445 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  38.71 
 
 
447 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  39.95 
 
 
443 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  40.69 
 
 
441 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  40.69 
 
 
441 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  40.15 
 
 
461 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  40.46 
 
 
441 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  40.65 
 
 
425 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  40.33 
 
 
425 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
440 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  40.33 
 
 
425 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  40.97 
 
 
426 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  40.33 
 
 
425 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  40.97 
 
 
426 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  40.97 
 
 
426 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.86 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  40.99 
 
 
440 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
438 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  40.92 
 
 
425 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
443 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  40.47 
 
 
425 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  39.1 
 
 
473 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  39.24 
 
 
445 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  40.23 
 
 
425 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  36.9 
 
 
438 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  36.28 
 
 
435 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  38.59 
 
 
425 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  41.04 
 
 
427 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  36.73 
 
 
435 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  36.73 
 
 
435 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  36.73 
 
 
435 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 
438 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 
424 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  36.73 
 
 
435 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  36.51 
 
 
435 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 
425 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  37.96 
 
 
434 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  36.51 
 
 
435 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
443 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.95 
 
 
425 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
425 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  37.95 
 
 
440 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  38.06 
 
 
442 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
457 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  36.45 
 
 
436 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  36.47 
 
 
430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  36.24 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  36.47 
 
 
430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  36.47 
 
 
430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  36.24 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  36.47 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  37.2 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  36.47 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  36.61 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  36.47 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  38.41 
 
 
428 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  38.41 
 
 
428 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  36.69 
 
 
436 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  36.69 
 
 
436 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  38.48 
 
 
431 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.06 
 
 
454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  38.18 
 
 
428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>