More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0897 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  100 
 
 
432 aa  851    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  85.65 
 
 
439 aa  709    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  85.17 
 
 
439 aa  706    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  66.03 
 
 
442 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  63.15 
 
 
445 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  52.56 
 
 
448 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  51.86 
 
 
453 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  50.9 
 
 
466 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  50.6 
 
 
437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  50.84 
 
 
437 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  50.84 
 
 
437 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  50.48 
 
 
437 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  49.76 
 
 
437 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  48.82 
 
 
441 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  49.05 
 
 
441 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  49.29 
 
 
439 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  48.58 
 
 
441 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  48.58 
 
 
441 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  48.34 
 
 
441 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  47.89 
 
 
438 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  47.42 
 
 
438 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 
433 aa  362  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  45.07 
 
 
443 aa  362  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  45.31 
 
 
443 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  45.73 
 
 
445 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  45.73 
 
 
445 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  45.73 
 
 
445 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  45.73 
 
 
445 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  45.73 
 
 
445 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.99 
 
 
440 aa  358  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  45.41 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  45.41 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  46.02 
 
 
420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  44.93 
 
 
443 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  44.93 
 
 
443 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 
440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  46.06 
 
 
440 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  44.88 
 
 
447 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  44.63 
 
 
431 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  46.19 
 
 
430 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 
434 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 
434 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  46.28 
 
 
433 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  43.72 
 
 
435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.62 
 
 
430 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  43.96 
 
 
435 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 
443 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  44.93 
 
 
434 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  44.58 
 
 
434 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  43.24 
 
 
435 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  43.31 
 
 
430 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  43.31 
 
 
430 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  43.31 
 
 
430 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  43.31 
 
 
430 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  43.31 
 
 
430 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  43.24 
 
 
435 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  43.19 
 
 
430 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.34 
 
 
435 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  43.24 
 
 
435 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  42.82 
 
 
436 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  43.07 
 
 
430 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  43.6 
 
 
417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  43.18 
 
 
461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  42.89 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 
443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  43.03 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  43.03 
 
 
435 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  43.07 
 
 
438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  43.07 
 
 
438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  42.86 
 
 
438 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  42.82 
 
 
438 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  41.44 
 
 
437 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  43 
 
 
430 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  42.57 
 
 
431 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  41.85 
 
 
438 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
438 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  42.48 
 
 
438 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 
438 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  46.96 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  46.96 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  46.96 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  41.94 
 
 
438 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  45.12 
 
 
463 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  41.06 
 
 
436 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  40.19 
 
 
436 aa  309  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  42.66 
 
 
436 aa  308  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  40.58 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  40.79 
 
 
437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  42.66 
 
 
436 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  42.66 
 
 
436 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  42.13 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  44.06 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  44.06 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  42.89 
 
 
433 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  42.03 
 
 
433 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  41.55 
 
 
433 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 
425 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  40.55 
 
 
440 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  42.57 
 
 
443 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>