More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2432 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  99.77 
 
 
435 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  84.49 
 
 
430 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  93.1 
 
 
435 aa  799    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  85.82 
 
 
417 aa  715    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  84.72 
 
 
430 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  100 
 
 
435 aa  850    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  97.47 
 
 
435 aa  834    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  82.31 
 
 
440 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  97.93 
 
 
435 aa  838    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  83.25 
 
 
430 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  84.95 
 
 
430 aa  730    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  84.49 
 
 
430 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  84.49 
 
 
430 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  82.31 
 
 
430 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  97.7 
 
 
435 aa  836    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  84.72 
 
 
430 aa  727    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  100 
 
 
435 aa  850    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  84.49 
 
 
430 aa  726    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  51.55 
 
 
443 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  51.32 
 
 
443 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  53.04 
 
 
447 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  51.28 
 
 
437 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.45 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  51.56 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  51.16 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  51.56 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  51.3 
 
 
439 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  51.54 
 
 
439 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  51.72 
 
 
438 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  49.75 
 
 
436 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  48.2 
 
 
436 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  50 
 
 
436 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  50.49 
 
 
440 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  51.23 
 
 
438 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  50.62 
 
 
431 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  50.61 
 
 
438 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  48.68 
 
 
436 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  51.72 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
438 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  52.8 
 
 
433 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  47.62 
 
 
425 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  48.78 
 
 
499 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.76 
 
 
454 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50 
 
 
425 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  48.04 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  49.29 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  48.04 
 
 
425 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  46.32 
 
 
425 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  48.04 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  48.04 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  45.62 
 
 
457 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  47.69 
 
 
436 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  48.26 
 
 
427 aa  372  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  47.26 
 
 
425 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  46.94 
 
 
438 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  47.96 
 
 
425 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  46.37 
 
 
427 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  47.26 
 
 
428 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  46.4 
 
 
442 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  46.54 
 
 
428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  46.3 
 
 
428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  46.3 
 
 
428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  48.49 
 
 
440 aa  348  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.1 
 
 
440 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  43.52 
 
 
431 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 
433 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  42.46 
 
 
443 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  44.28 
 
 
443 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  47.04 
 
 
441 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  44.28 
 
 
443 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  44.28 
 
 
443 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  44 
 
 
443 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  46.3 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  47.02 
 
 
428 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  43.76 
 
 
443 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  47.26 
 
 
428 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  43.56 
 
 
453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  44.85 
 
 
442 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  43.5 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  44.44 
 
 
445 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  41.87 
 
 
437 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  43.26 
 
 
428 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  44.2 
 
 
445 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  44.23 
 
 
437 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
434 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  42.4 
 
 
466 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.39 
 
 
440 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  45.39 
 
 
440 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  44.44 
 
 
437 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.44 
 
 
437 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  45.43 
 
 
438 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 
434 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  43.24 
 
 
432 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  45.23 
 
 
434 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  42.14 
 
 
449 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  43.95 
 
 
445 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  43.95 
 
 
445 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  43.95 
 
 
420 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  43.95 
 
 
445 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>