More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3091 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  93.32 
 
 		 435 aa  797    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  85.19 
 
 		 430 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  100 
 
 		 435 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  85.19 
 
 		 430 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  86.3 
 
 		 417 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  85.42 
 
 		 430 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  83.37 
 
 		 430 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  85.42 
 
 		 430 aa  729    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  97.24 
 
 		 435 aa  831    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  82.31 
 
 		 440 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  85.65 
 
 		 430 aa  732    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  99.77 
 
 		 435 aa  848    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  97.7 
 
 		 435 aa  836    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  82.9 
 
 		 430 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  85.19 
 
 		 430 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  97.93 
 
 		 435 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  97.7 
 
 		 435 aa  836    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  85.19 
 
 		 430 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  53.53 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  50.84 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.21 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  51.4 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  51.4 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  51.53 
 
 		 439 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  51.53 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  49.26 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  49.75 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  48.64 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  50.85 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  51.07 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  49.65 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  52.29 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.76 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  48.98 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.64 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  48.42 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  47.91 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  48.26 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  46.37 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  46.47 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 442 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  47.02 
 
 		 428 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 431 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 443 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 428 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  47.04 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  47.49 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  43.74 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  43.33 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  42.89 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  45.01 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 449 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  44.47 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  44.53 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  44.69 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.69 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 		 444 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 447 aa  329  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.14 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  45.14 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  44.28 
 
 		 445 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  42.5 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  44.74 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.12 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>