More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0906 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  97.27 
 
 		 439 aa  838    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  85.17 
 
 		 432 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  864    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  67.29 
 
 		 442 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  66.28 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  53.14 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  51.44 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  50.68 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  51.2 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  51.44 
 
 		 437 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  51.44 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  50 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  50.47 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  50.47 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  49.55 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 440 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 		 433 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  44.99 
 
 		 443 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  45.99 
 
 		 445 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 443 aa  352  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 443 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  45.99 
 
 		 445 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  45.99 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 440 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  45.99 
 
 		 445 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  45.99 
 
 		 445 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  45.99 
 
 		 445 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 430 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.5 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 431 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  43.9 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  46 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  45.3 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.14 
 
 		 430 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  43.63 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  42.93 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  42.93 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  42.93 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  42.93 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  42.93 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  42.93 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  43.38 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  42.96 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  42.96 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 438 aa  328  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  42.96 
 
 		 435 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 438 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  42.04 
 
 		 435 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  48.54 
 
 		 426 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  48.54 
 
 		 426 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  48.54 
 
 		 426 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  44.01 
 
 		 438 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  42.04 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  42.3 
 
 		 440 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  42.51 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  45.04 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  44.77 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.96 
 
 		 454 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  43.3 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 437 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  41.41 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  41.06 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.26 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 463 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  42.89 
 
 		 433 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>