More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5758 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  100 
 
 		 443 aa  858    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  48.46 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  49.16 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  49.16 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  49.16 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  48.16 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1266  major facilitator family transporter  48.37 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1404  major facilitator family transporter  48.12 
 
 		 482 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1258  major facilitator family transporter  48.12 
 
 		 485 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1100  major facilitator family transporter  47.87 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513292  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0766  major facilitator family transporter  47.87 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0383  major facilitator family transporter  47.87 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1862  major facilitator family transporter  47.87 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55220  MFS family transporter  50.61 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.872465  hitchhiker  0.00000012197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 439 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  43.99 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  44.23 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 448 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  43.51 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 439 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 441 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  41.78 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 441 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  43.28 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 441 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4806  MFS family transporter  49.64 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  42.75 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  42.75 
 
 		 430 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  42.75 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  42.75 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  42.75 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  42.75 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 443 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 443 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  42.51 
 
 		 417 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2097  general substrate transporter  46.04 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00320357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 438 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  44.95 
 
 		 434 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 440 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  42.75 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 443 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  40.66 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5425  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.460942  normal  0.126626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.34 
 
 		 430 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  40.29 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  40.29 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  40.05 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 445 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 425 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 425 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 425 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  39.33 
 
 		 435 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  39.33 
 
 		 435 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 425 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  38.65 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  41.28 
 
 		 445 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 438 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  41.03 
 
 		 445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 438 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  41.03 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  41.03 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  41.03 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 447 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  41.03 
 
 		 420 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  41 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  39.61 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  41.46 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>