More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4913 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  74.71 
 
 
436 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  75 
 
 
436 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  74.48 
 
 
436 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  100 
 
 
439 aa  857    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  91.8 
 
 
439 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  73.84 
 
 
436 aa  633  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  68.79 
 
 
440 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  69.46 
 
 
438 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  71.7 
 
 
433 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.35 
 
 
430 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  54.48 
 
 
430 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  54.23 
 
 
430 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  54.23 
 
 
417 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  54.23 
 
 
430 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  53.25 
 
 
430 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  52.01 
 
 
435 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  54.23 
 
 
430 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  53.25 
 
 
430 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  51.4 
 
 
437 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  53.05 
 
 
430 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  52.72 
 
 
435 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  51.04 
 
 
440 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  53.98 
 
 
430 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  51.54 
 
 
435 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  51.54 
 
 
435 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  51.54 
 
 
435 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  51.53 
 
 
435 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  51.53 
 
 
435 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  51.58 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  52.39 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  49.15 
 
 
447 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  46.72 
 
 
438 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  46.72 
 
 
438 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 
438 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  47.45 
 
 
438 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.93 
 
 
435 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  46.72 
 
 
438 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  47.33 
 
 
436 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  46.96 
 
 
438 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  47.65 
 
 
438 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  46.85 
 
 
438 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  46.81 
 
 
425 aa  362  8e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  46.72 
 
 
425 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  48.58 
 
 
442 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.13 
 
 
425 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  45.18 
 
 
425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  46.37 
 
 
431 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  44.94 
 
 
425 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  44.94 
 
 
425 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  44.94 
 
 
425 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  44.94 
 
 
425 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 
425 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  47.96 
 
 
441 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  46.08 
 
 
427 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  45.12 
 
 
425 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  48.08 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
427 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  44.34 
 
 
442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  48.56 
 
 
428 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  48.09 
 
 
428 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  44.17 
 
 
499 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  48.2 
 
 
428 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 
457 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.19 
 
 
454 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  47.37 
 
 
428 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  47.37 
 
 
428 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  47.13 
 
 
428 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  42.86 
 
 
428 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.93 
 
 
440 aa  326  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
439 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
444 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 
439 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  43.03 
 
 
440 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.28 
 
 
452 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 
429 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  45.52 
 
 
443 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  43.2 
 
 
440 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  45.52 
 
 
443 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  45.52 
 
 
443 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  42.13 
 
 
447 aa  323  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 
452 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  44.81 
 
 
443 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  48.14 
 
 
440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  44.86 
 
 
443 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  43.95 
 
 
440 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  43.95 
 
 
440 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 
433 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  45.09 
 
 
443 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  42.14 
 
 
453 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  46.03 
 
 
445 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  46.03 
 
 
445 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  46.03 
 
 
445 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  46.03 
 
 
445 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  46.03 
 
 
420 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.2 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  41.08 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  43.95 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  44.06 
 
 
432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>