More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5418 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  100 
 
 		 434 aa  850    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  50.94 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  48.84 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  52.35 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  52.08 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  51.6 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  54.1 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2288  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.92 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0638565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  50.23 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  48.54 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  48.69 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  49.03 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  49.27 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  51.52 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  48.22 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  48.13 
 
 		 433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  46.31 
 
 		 445 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  46.31 
 
 		 445 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  46.31 
 
 		 445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  46.31 
 
 		 445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  46.31 
 
 		 445 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  46.41 
 
 		 443 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 		 439 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 439 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  47.76 
 
 		 420 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.21 
 
 		 430 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  46.23 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  46.23 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  46.23 
 
 		 435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  46.23 
 
 		 435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  45.99 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  45.99 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  46.36 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 461 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  45.09 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  45.09 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  45.09 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  45.09 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 438 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.91 
 
 		 435 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  45.09 
 
 		 430 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  45.78 
 
 		 417 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  45.09 
 
 		 430 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  42.18 
 
 		 453 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  44.89 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 448 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  46.92 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.47 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  44.13 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  44.47 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  43.16 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 442 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  43.51 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  44.91 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 438 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 437 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  42.08 
 
 		 438 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 431 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  44.28 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 438 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 428 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>