More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2584 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  856    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  98.63 
 
 		 438 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  69.93 
 
 		 440 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  51.64 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  53.24 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  53.24 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  52.53 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  50.93 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  50.46 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  50.93 
 
 		 439 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  48.65 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  49.07 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  49.18 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  49.65 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 432 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  47.18 
 
 		 443 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  49.27 
 
 		 445 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  49.27 
 
 		 445 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  49.27 
 
 		 445 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  49.27 
 
 		 420 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  49.27 
 
 		 445 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  49.26 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  49.03 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 		 443 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 461 aa  342  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  46.14 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  46.14 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  46.14 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  46.14 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  46 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  46.14 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  46.14 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.55 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 431 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  45.22 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  45.45 
 
 		 435 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  45.22 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  45.45 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 447 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  45.22 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  45.22 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  45.56 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  43.5 
 
 		 438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  44.26 
 
 		 440 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.13 
 
 		 430 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 438 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  43.66 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 437 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 535 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 425 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 433 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 440 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  44.06 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 428 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  45 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  45 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 428 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  43.3 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  41.4 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  42.42 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>