More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2520 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  99.03 
 
 
413 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  99.53 
 
 
425 aa  831    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  100 
 
 
452 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  99.03 
 
 
413 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  98.85 
 
 
435 aa  849    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  58.77 
 
 
427 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  55.86 
 
 
428 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  54.03 
 
 
428 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  54.28 
 
 
428 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  54.28 
 
 
428 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  55.01 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  56.36 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  54.52 
 
 
428 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  55.04 
 
 
425 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  55.78 
 
 
428 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  53.27 
 
 
440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  55.61 
 
 
424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  53.12 
 
 
425 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  52.87 
 
 
425 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  52.37 
 
 
425 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  52.12 
 
 
425 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  48.59 
 
 
431 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  52.87 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  51.62 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  51.62 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.37 
 
 
425 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  51.62 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  51.68 
 
 
425 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  48.01 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  50.12 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 
438 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  46.45 
 
 
442 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 
438 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 
457 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  46.72 
 
 
438 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.94 
 
 
454 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  46.73 
 
 
444 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  42.76 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
443 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.04 
 
 
435 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
430 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
430 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
430 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
417 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
430 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
430 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
430 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.96 
 
 
430 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  42.34 
 
 
447 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  43.67 
 
 
461 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  41.67 
 
 
438 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  45.05 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  42.05 
 
 
438 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  41.91 
 
 
438 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  41.91 
 
 
438 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  43.72 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  43.56 
 
 
435 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  41.56 
 
 
438 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  43.56 
 
 
435 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  42.17 
 
 
436 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  43.07 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  44.2 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  43.07 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  43.07 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  42.57 
 
 
435 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  42.57 
 
 
435 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  41.81 
 
 
438 aa  312  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  39.58 
 
 
436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  41.26 
 
 
431 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  39.81 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  40.15 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  42.03 
 
 
453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  41.56 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  41.77 
 
 
448 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  39.52 
 
 
437 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  41.3 
 
 
438 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  39.52 
 
 
437 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  41.76 
 
 
438 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  39.56 
 
 
436 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  40.77 
 
 
439 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  41.58 
 
 
431 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 
440 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  43.78 
 
 
442 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  40 
 
 
440 aa  296  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  39.76 
 
 
439 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  39.28 
 
 
437 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  39.28 
 
 
437 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  40.05 
 
 
466 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  38.98 
 
 
438 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  38.44 
 
 
440 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  38.8 
 
 
433 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  41.12 
 
 
433 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4980  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.31 
 
 
431 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  40.2 
 
 
437 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 
439 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 
439 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 
434 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 
434 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.57 
 
 
431 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  38.57 
 
 
431 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>